Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM43Q9BTV4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM43Q9BTV4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM43Q9BTV4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM43Q9BTV4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM43Q9BTV4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM43Q9BTV4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM43Q9BTV4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM43Q9BTV4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM43Q9BTV4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM43Q9BTV4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM43Q9BTV4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM43Q9BTV4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM43Q9BTV4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM43Q9BTV4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM43Q9BTV4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM43Q9BTV4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM43Q9BTV4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM43Q9BTV4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM43Q9BTV4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM43Q9BTV4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM43Q9BTV4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMEM43Q9BTV4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMEM43Q9BTV4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM43Q9BTV4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM43Q9BTV4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM43Q9BTV4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM43Q9BTV4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM43Q9BTV4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM43Q9BTV4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM43Q9BTV4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM43Q9BTV4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM43Q9BTV4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM43Q9BTV4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM43Q9BTV4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM43Q9BTV4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM43Q9BTV4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM43Q9BTV4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM43Q9BTV4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM43Q9BTV4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM43Q9BTV4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM43Q9BTV4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM43Q9BTV4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM43Q9BTV4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM43Q9BTV4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM43Q9BTV4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM43Q9BTV4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM43Q9BTV4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM43Q9BTV4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM43Q9BTV4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM43Q9BTV4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM43Q9BTV4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM43Q9BTV4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM43Q9BTV4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM43Q9BTV4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM43Q9BTV4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM43Q9BTV4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM43Q9BTV4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM43Q9BTV4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM43Q9BTV4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM43Q9BTV4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM43Q9BTV4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM43Q9BTV4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM43Q9BTV4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM43Q9BTV4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM43Q9BTV4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM43Q9BTV4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM43Q9BTV4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM43Q9BTV4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM43Q9BTV4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM43Q9BTV4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM43Q9BTV4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM43Q9BTV4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM43Q9BTV4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM43Q9BTV4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM43Q9BTV4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM43Q9BTV4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM43Q9BTV4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM43Q9BTV4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM43Q9BTV4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM43Q9BTV4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM43Q9BTV4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM43Q9BTV4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM43Q9BTV4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM43Q9BTV4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM43Q9BTV4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM43Q9BTV4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM43Q9BTV4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM43Q9BTV4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM43Q9BTV4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM43Q9BTV4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM43Q9BTV4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM43Q9BTV4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM43Q9BTV4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM43Q9BTV4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM43Q9BTV4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM43Q9BTV4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM43Q9BTV4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM43Q9BTV4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM43Q9BTV4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms