Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTL4

IER2, Immediate early response gene 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IER2Q9BTL4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
IER2Q9BTL4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
IER2Q9BTL4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
IER2Q9BTL4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IER2Q9BTL4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
IER2Q9BTL4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IER2Q9BTL4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IER2Q9BTL4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IER2Q9BTL4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
IER2Q9BTL4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IER2Q9BTL4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IER2Q9BTL4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IER2Q9BTL4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IER2Q9BTL4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IER2Q9BTL4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IER2Q9BTL4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IER2Q9BTL4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
IER2Q9BTL4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
IER2Q9BTL4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IER2Q9BTL4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IER2Q9BTL4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IER2Q9BTL4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IER2Q9BTL4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IER2Q9BTL4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IER2Q9BTL4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
IER2Q9BTL4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IER2Q9BTL4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
IER2Q9BTL4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IER2Q9BTL4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IER2Q9BTL4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IER2Q9BTL4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IER2Q9BTL4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
IER2Q9BTL4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IER2Q9BTL4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IER2Q9BTL4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IER2Q9BTL4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IER2Q9BTL4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
IER2Q9BTL4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IER2Q9BTL4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IER2Q9BTL4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IER2Q9BTL4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IER2Q9BTL4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
IER2Q9BTL4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IER2Q9BTL4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IER2Q9BTL4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IER2Q9BTL4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IER2Q9BTL4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
IER2Q9BTL4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
IER2Q9BTL4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IER2Q9BTL4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
IER2Q9BTL4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IER2Q9BTL4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
IER2Q9BTL4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IER2Q9BTL4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IER2Q9BTL4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IER2Q9BTL4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IER2Q9BTL4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IER2Q9BTL4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IER2Q9BTL4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IER2Q9BTL4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IER2Q9BTL4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IER2Q9BTL4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IER2Q9BTL4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IER2Q9BTL4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IER2Q9BTL4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IER2Q9BTL4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IER2Q9BTL4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IER2Q9BTL4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IER2Q9BTL4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IER2Q9BTL4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IER2Q9BTL4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IER2Q9BTL4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IER2Q9BTL4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IER2Q9BTL4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IER2Q9BTL4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IER2Q9BTL4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IER2Q9BTL4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IER2Q9BTL4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IER2Q9BTL4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IER2Q9BTL4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IER2Q9BTL4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IER2Q9BTL4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IER2Q9BTL4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
IER2Q9BTL4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IER2Q9BTL4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IER2Q9BTL4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IER2Q9BTL4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IER2Q9BTL4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IER2Q9BTL4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IER2Q9BTL4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
IER2Q9BTL4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IER2Q9BTL4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IER2Q9BTL4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
IER2Q9BTL4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IER2Q9BTL4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IER2Q9BTL4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
IER2Q9BTL4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IER2Q9BTL4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IER2Q9BTL4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IER2Q9BTL4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.8 ms