Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TREX2Q9BQ50 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TREX2Q9BQ50 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TREX2Q9BQ50 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TREX2Q9BQ50 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TREX2Q9BQ50 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TREX2Q9BQ50 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TREX2Q9BQ50 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TREX2Q9BQ50 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TREX2Q9BQ50 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TREX2Q9BQ50 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TREX2Q9BQ50 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TREX2Q9BQ50 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TREX2Q9BQ50 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TREX2Q9BQ50 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TREX2Q9BQ50 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TREX2Q9BQ50 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TREX2Q9BQ50 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TREX2Q9BQ50 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TREX2Q9BQ50 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TREX2Q9BQ50 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TREX2Q9BQ50 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TREX2Q9BQ50 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TREX2Q9BQ50 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TREX2Q9BQ50 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TREX2Q9BQ50 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TREX2Q9BQ50 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TREX2Q9BQ50 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TREX2Q9BQ50 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TREX2Q9BQ50 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TREX2Q9BQ50 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TREX2Q9BQ50 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TREX2Q9BQ50 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TREX2Q9BQ50 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TREX2Q9BQ50 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TREX2Q9BQ50 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TREX2Q9BQ50 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TREX2Q9BQ50 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TREX2Q9BQ50 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TREX2Q9BQ50 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TREX2Q9BQ50 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TREX2Q9BQ50 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TREX2Q9BQ50 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TREX2Q9BQ50 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TREX2Q9BQ50 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TREX2Q9BQ50 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TREX2Q9BQ50 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TREX2Q9BQ50 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TREX2Q9BQ50 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TREX2Q9BQ50 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TREX2Q9BQ50 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TREX2Q9BQ50 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TREX2Q9BQ50 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TREX2Q9BQ50 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TREX2Q9BQ50 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TREX2Q9BQ50 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TREX2Q9BQ50 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TREX2Q9BQ50 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TREX2Q9BQ50 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TREX2Q9BQ50 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TREX2Q9BQ50 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TREX2Q9BQ50 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TREX2Q9BQ50 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TREX2Q9BQ50 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TREX2Q9BQ50 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TREX2Q9BQ50 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TREX2Q9BQ50 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TREX2Q9BQ50 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TREX2Q9BQ50 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TREX2Q9BQ50 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TREX2Q9BQ50 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TREX2Q9BQ50 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TREX2Q9BQ50 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TREX2Q9BQ50 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TREX2Q9BQ50 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TREX2Q9BQ50 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TREX2Q9BQ50 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TREX2Q9BQ50 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TREX2Q9BQ50 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TREX2Q9BQ50 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TREX2Q9BQ50 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TREX2Q9BQ50 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TREX2Q9BQ50 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TREX2Q9BQ50 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TREX2Q9BQ50 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TREX2Q9BQ50 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TREX2Q9BQ50 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TREX2Q9BQ50 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TREX2Q9BQ50 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TREX2Q9BQ50 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TREX2Q9BQ50 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TREX2Q9BQ50 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TREX2Q9BQ50 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TREX2Q9BQ50 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TREX2Q9BQ50 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TREX2Q9BQ50 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TREX2Q9BQ50 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TREX2Q9BQ50 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TREX2Q9BQ50 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TREX2Q9BQ50 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.6 ms