Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VGLL1Q99990 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VGLL1Q99990 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VGLL1Q99990 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VGLL1Q99990 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VGLL1Q99990 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VGLL1Q99990 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VGLL1Q99990 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VGLL1Q99990 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VGLL1Q99990 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VGLL1Q99990 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VGLL1Q99990 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VGLL1Q99990 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VGLL1Q99990 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VGLL1Q99990 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VGLL1Q99990 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VGLL1Q99990 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VGLL1Q99990 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VGLL1Q99990 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VGLL1Q99990 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VGLL1Q99990 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VGLL1Q99990 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VGLL1Q99990 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VGLL1Q99990 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VGLL1Q99990 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VGLL1Q99990 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VGLL1Q99990 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VGLL1Q99990 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VGLL1Q99990 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VGLL1Q99990 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VGLL1Q99990 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VGLL1Q99990 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VGLL1Q99990 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VGLL1Q99990 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
VGLL1Q99990 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VGLL1Q99990 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VGLL1Q99990 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
VGLL1Q99990 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VGLL1Q99990 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
VGLL1Q99990 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
VGLL1Q99990 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VGLL1Q99990 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VGLL1Q99990 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VGLL1Q99990 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VGLL1Q99990 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VGLL1Q99990 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VGLL1Q99990 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VGLL1Q99990 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VGLL1Q99990 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VGLL1Q99990 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VGLL1Q99990 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VGLL1Q99990 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VGLL1Q99990 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VGLL1Q99990 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VGLL1Q99990 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VGLL1Q99990 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VGLL1Q99990 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
VGLL1Q99990 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VGLL1Q99990 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VGLL1Q99990 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VGLL1Q99990 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
VGLL1Q99990 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL1Q99990 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL1Q99990 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL1Q99990 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL1Q99990 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VGLL1Q99990 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VGLL1Q99990 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VGLL1Q99990 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VGLL1Q99990 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VGLL1Q99990 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VGLL1Q99990 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VGLL1Q99990 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VGLL1Q99990 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
VGLL1Q99990 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VGLL1Q99990 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VGLL1Q99990 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VGLL1Q99990 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VGLL1Q99990 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VGLL1Q99990 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VGLL1Q99990 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VGLL1Q99990 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VGLL1Q99990 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VGLL1Q99990 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VGLL1Q99990 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VGLL1Q99990 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
VGLL1Q99990 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VGLL1Q99990 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VGLL1Q99990 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VGLL1Q99990 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VGLL1Q99990 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VGLL1Q99990 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VGLL1Q99990 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VGLL1Q99990 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VGLL1Q99990 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VGLL1Q99990 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VGLL1Q99990 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VGLL1Q99990 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VGLL1Q99990 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VGLL1Q99990 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms