Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
ARID3AQ99856 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ARID3AQ99856 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ARID3AQ99856 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ARID3AQ99856 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ARID3AQ99856 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ARID3AQ99856 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ARID3AQ99856 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ARID3AQ99856 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ARID3AQ99856 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ARID3AQ99856 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ARID3AQ99856 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ARID3AQ99856 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
ARID3AQ99856 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
ARID3AQ99856 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ARID3AQ99856 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ARID3AQ99856 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ARID3AQ99856 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ARID3AQ99856 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ARID3AQ99856 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ARID3AQ99856 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ARID3AQ99856 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ARID3AQ99856 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ARID3AQ99856 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ARID3AQ99856 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ARID3AQ99856 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ARID3AQ99856 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ARID3AQ99856 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ARID3AQ99856 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ARID3AQ99856 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ARID3AQ99856 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ARID3AQ99856 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ARID3AQ99856 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ARID3AQ99856 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ARID3AQ99856 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ARID3AQ99856 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ARID3AQ99856 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ARID3AQ99856 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ARID3AQ99856 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
ARID3AQ99856 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ARID3AQ99856 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARID3AQ99856 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ARID3AQ99856 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ARID3AQ99856 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
ARID3AQ99856 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ARID3AQ99856 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ARID3AQ99856 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ARID3AQ99856 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ARID3AQ99856 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ARID3AQ99856 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ARID3AQ99856 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ARID3AQ99856 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ARID3AQ99856 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ARID3AQ99856 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ARID3AQ99856 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ARID3AQ99856 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ARID3AQ99856 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ARID3AQ99856 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ARID3AQ99856 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ARID3AQ99856 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ARID3AQ99856 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ARID3AQ99856 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ARID3AQ99856 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ARID3AQ99856 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
ARID3AQ99856 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ARID3AQ99856 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ARID3AQ99856 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ARID3AQ99856 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ARID3AQ99856 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ARID3AQ99856 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ARID3AQ99856 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ARID3AQ99856 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ARID3AQ99856 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ARID3AQ99856 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
ARID3AQ99856 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ARID3AQ99856 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ARID3AQ99856 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ARID3AQ99856 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ARID3AQ99856 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ARID3AQ99856 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ARID3AQ99856 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ARID3AQ99856 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ARID3AQ99856 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ARID3AQ99856 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
ARID3AQ99856 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ARID3AQ99856 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ARID3AQ99856 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ARID3AQ99856 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ARID3AQ99856 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ARID3AQ99856 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ARID3AQ99856 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ARID3AQ99856 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ARID3AQ99856 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ARID3AQ99856 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ARID3AQ99856 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ARID3AQ99856 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ARID3AQ99856 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ARID3AQ99856 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ARID3AQ99856 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ARID3AQ99856 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms