Protein–RNA interactions for Protein: Q99700

ATXN2, Ataxin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN2Q99700 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATXN2Q99700 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATXN2Q99700 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ATXN2Q99700 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATXN2Q99700 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ATXN2Q99700 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATXN2Q99700 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATXN2Q99700 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ATXN2Q99700 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ATXN2Q99700 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ATXN2Q99700 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATXN2Q99700 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATXN2Q99700 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATXN2Q99700 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATXN2Q99700 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATXN2Q99700 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATXN2Q99700 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATXN2Q99700 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATXN2Q99700 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATXN2Q99700 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATXN2Q99700 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATXN2Q99700 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATXN2Q99700 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATXN2Q99700 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATXN2Q99700 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATXN2Q99700 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATXN2Q99700 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATXN2Q99700 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATXN2Q99700 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ATXN2Q99700 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATXN2Q99700 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATXN2Q99700 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATXN2Q99700 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATXN2Q99700 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATXN2Q99700 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATXN2Q99700 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATXN2Q99700 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ATXN2Q99700 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATXN2Q99700 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
ATXN2Q99700 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATXN2Q99700 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATXN2Q99700 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATXN2Q99700 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATXN2Q99700 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATXN2Q99700 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATXN2Q99700 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATXN2Q99700 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATXN2Q99700 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATXN2Q99700 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ATXN2Q99700 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ATXN2Q99700 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATXN2Q99700 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATXN2Q99700 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATXN2Q99700 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ATXN2Q99700 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATXN2Q99700 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATXN2Q99700 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATXN2Q99700 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATXN2Q99700 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATXN2Q99700 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATXN2Q99700 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATXN2Q99700 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATXN2Q99700 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATXN2Q99700 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATXN2Q99700 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATXN2Q99700 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATXN2Q99700 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ATXN2Q99700 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATXN2Q99700 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATXN2Q99700 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
ATXN2Q99700 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATXN2Q99700 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATXN2Q99700 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATXN2Q99700 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATXN2Q99700 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATXN2Q99700 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATXN2Q99700 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATXN2Q99700 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATXN2Q99700 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATXN2Q99700 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATXN2Q99700 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATXN2Q99700 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATXN2Q99700 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATXN2Q99700 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATXN2Q99700 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATXN2Q99700 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATXN2Q99700 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATXN2Q99700 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATXN2Q99700 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATXN2Q99700 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ATXN2Q99700 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ATXN2Q99700 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ATXN2Q99700 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATXN2Q99700 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATXN2Q99700 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATXN2Q99700 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATXN2Q99700 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATXN2Q99700 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATXN2Q99700 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATXN2Q99700 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms