Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
POP1Q99575 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
POP1Q99575 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
POP1Q99575 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
POP1Q99575 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
POP1Q99575 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
POP1Q99575 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
POP1Q99575 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
POP1Q99575 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
POP1Q99575 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
POP1Q99575 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
POP1Q99575 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
POP1Q99575 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
POP1Q99575 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
POP1Q99575 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
POP1Q99575 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
POP1Q99575 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
POP1Q99575 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
POP1Q99575 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
POP1Q99575 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
POP1Q99575 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
POP1Q99575 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
POP1Q99575 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
POP1Q99575 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
POP1Q99575 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
POP1Q99575 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
POP1Q99575 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
POP1Q99575 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
POP1Q99575 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
POP1Q99575 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
POP1Q99575 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
POP1Q99575 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
POP1Q99575 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
POP1Q99575 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
POP1Q99575 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
POP1Q99575 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
POP1Q99575 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
POP1Q99575 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
POP1Q99575 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
POP1Q99575 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
POP1Q99575 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
POP1Q99575 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
POP1Q99575 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
POP1Q99575 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
POP1Q99575 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
POP1Q99575 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
POP1Q99575 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
POP1Q99575 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
POP1Q99575 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
POP1Q99575 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
POP1Q99575 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
POP1Q99575 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
POP1Q99575 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
POP1Q99575 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
POP1Q99575 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
POP1Q99575 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
POP1Q99575 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
POP1Q99575 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
POP1Q99575 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
POP1Q99575 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
POP1Q99575 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
POP1Q99575 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
POP1Q99575 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
POP1Q99575 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
POP1Q99575 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
POP1Q99575 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
POP1Q99575 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
POP1Q99575 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
POP1Q99575 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
POP1Q99575 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
POP1Q99575 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
POP1Q99575 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
POP1Q99575 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
POP1Q99575 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
POP1Q99575 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
POP1Q99575 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
POP1Q99575 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
POP1Q99575 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
POP1Q99575 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
POP1Q99575 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
POP1Q99575 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
POP1Q99575 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
POP1Q99575 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
POP1Q99575 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
POP1Q99575 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
POP1Q99575 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
POP1Q99575 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
POP1Q99575 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
POP1Q99575 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
POP1Q99575 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
POP1Q99575 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
POP1Q99575 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
POP1Q99575 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
POP1Q99575 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
POP1Q99575 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
POP1Q99575 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
POP1Q99575 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
POP1Q99575 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
POP1Q99575 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
POP1Q99575 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms