Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
PSMD1Q99460 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
PSMD1Q99460 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PSMD1Q99460 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PSMD1Q99460 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PSMD1Q99460 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PSMD1Q99460 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PSMD1Q99460 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
PSMD1Q99460 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PSMD1Q99460 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PSMD1Q99460 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PSMD1Q99460 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PSMD1Q99460 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PSMD1Q99460 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PSMD1Q99460 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PSMD1Q99460 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PSMD1Q99460 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
PSMD1Q99460 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PSMD1Q99460 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PSMD1Q99460 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PSMD1Q99460 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PSMD1Q99460 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PSMD1Q99460 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PSMD1Q99460 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PSMD1Q99460 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
PSMD1Q99460 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PSMD1Q99460 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PSMD1Q99460 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
PSMD1Q99460 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
PSMD1Q99460 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PSMD1Q99460 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
PSMD1Q99460 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PSMD1Q99460 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PSMD1Q99460 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PSMD1Q99460 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PSMD1Q99460 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
PSMD1Q99460 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PSMD1Q99460 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PSMD1Q99460 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PSMD1Q99460 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PSMD1Q99460 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PSMD1Q99460 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PSMD1Q99460 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PSMD1Q99460 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PSMD1Q99460 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PSMD1Q99460 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PSMD1Q99460 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
PSMD1Q99460 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PSMD1Q99460 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
PSMD1Q99460 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PSMD1Q99460 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PSMD1Q99460 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PSMD1Q99460 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PSMD1Q99460 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PSMD1Q99460 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
PSMD1Q99460 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PSMD1Q99460 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PSMD1Q99460 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PSMD1Q99460 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PSMD1Q99460 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PSMD1Q99460 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PSMD1Q99460 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PSMD1Q99460 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PSMD1Q99460 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PSMD1Q99460 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PSMD1Q99460 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PSMD1Q99460 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
PSMD1Q99460 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PSMD1Q99460 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PSMD1Q99460 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PSMD1Q99460 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PSMD1Q99460 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PSMD1Q99460 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PSMD1Q99460 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PSMD1Q99460 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PSMD1Q99460 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PSMD1Q99460 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PSMD1Q99460 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PSMD1Q99460 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PSMD1Q99460 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PSMD1Q99460 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PSMD1Q99460 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PSMD1Q99460 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PSMD1Q99460 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PSMD1Q99460 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PSMD1Q99460 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PSMD1Q99460 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PSMD1Q99460 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PSMD1Q99460 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PSMD1Q99460 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PSMD1Q99460 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC34■■■■□ 3.03
PSMD1Q99460 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
PSMD1Q99460 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PSMD1Q99460 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PSMD1Q99460 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PSMD1Q99460 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PSMD1Q99460 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PSMD1Q99460 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PSMD1Q99460 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PSMD1Q99460 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms