Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
C9orf72Q96LT7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C9orf72Q96LT7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
C9orf72Q96LT7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
C9orf72Q96LT7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
C9orf72Q96LT7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C9orf72Q96LT7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
C9orf72Q96LT7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
C9orf72Q96LT7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C9orf72Q96LT7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C9orf72Q96LT7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
C9orf72Q96LT7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
C9orf72Q96LT7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
C9orf72Q96LT7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
C9orf72Q96LT7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
C9orf72Q96LT7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C9orf72Q96LT7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C9orf72Q96LT7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
C9orf72Q96LT7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C9orf72Q96LT7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
C9orf72Q96LT7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
C9orf72Q96LT7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C9orf72Q96LT7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C9orf72Q96LT7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C9orf72Q96LT7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
C9orf72Q96LT7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
C9orf72Q96LT7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
C9orf72Q96LT7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
C9orf72Q96LT7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
C9orf72Q96LT7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
C9orf72Q96LT7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
C9orf72Q96LT7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
C9orf72Q96LT7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
C9orf72Q96LT7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
C9orf72Q96LT7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
C9orf72Q96LT7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
C9orf72Q96LT7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
C9orf72Q96LT7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
C9orf72Q96LT7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
C9orf72Q96LT7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
C9orf72Q96LT7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
C9orf72Q96LT7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
C9orf72Q96LT7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
C9orf72Q96LT7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
C9orf72Q96LT7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
C9orf72Q96LT7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
C9orf72Q96LT7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
C9orf72Q96LT7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
C9orf72Q96LT7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
C9orf72Q96LT7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
C9orf72Q96LT7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
C9orf72Q96LT7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C9orf72Q96LT7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
C9orf72Q96LT7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
C9orf72Q96LT7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C9orf72Q96LT7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C9orf72Q96LT7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
C9orf72Q96LT7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
C9orf72Q96LT7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
C9orf72Q96LT7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
C9orf72Q96LT7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C9orf72Q96LT7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C9orf72Q96LT7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C9orf72Q96LT7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
C9orf72Q96LT7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
C9orf72Q96LT7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
C9orf72Q96LT7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C9orf72Q96LT7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C9orf72Q96LT7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C9orf72Q96LT7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
C9orf72Q96LT7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C9orf72Q96LT7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C9orf72Q96LT7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C9orf72Q96LT7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C9orf72Q96LT7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
C9orf72Q96LT7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
C9orf72Q96LT7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
C9orf72Q96LT7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C9orf72Q96LT7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C9orf72Q96LT7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C9orf72Q96LT7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C9orf72Q96LT7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
C9orf72Q96LT7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C9orf72Q96LT7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
C9orf72Q96LT7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
C9orf72Q96LT7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C9orf72Q96LT7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C9orf72Q96LT7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C9orf72Q96LT7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
C9orf72Q96LT7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C9orf72Q96LT7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C9orf72Q96LT7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C9orf72Q96LT7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
C9orf72Q96LT7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
C9orf72Q96LT7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
C9orf72Q96LT7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
C9orf72Q96LT7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
C9orf72Q96LT7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
C9orf72Q96LT7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
C9orf72Q96LT7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms