Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
MS4A4AQ96JQ5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
MS4A4AQ96JQ5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
MS4A4AQ96JQ5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
MS4A4AQ96JQ5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
MS4A4AQ96JQ5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
MS4A4AQ96JQ5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
MS4A4AQ96JQ5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
MS4A4AQ96JQ5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
MS4A4AQ96JQ5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
MS4A4AQ96JQ5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
MS4A4AQ96JQ5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
MS4A4AQ96JQ5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
MS4A4AQ96JQ5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
MS4A4AQ96JQ5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
MS4A4AQ96JQ5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
MS4A4AQ96JQ5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
MS4A4AQ96JQ5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
MS4A4AQ96JQ5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
MS4A4AQ96JQ5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
MS4A4AQ96JQ5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
MS4A4AQ96JQ5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
MS4A4AQ96JQ5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
MS4A4AQ96JQ5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
MS4A4AQ96JQ5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
MS4A4AQ96JQ5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
MS4A4AQ96JQ5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
MS4A4AQ96JQ5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
MS4A4AQ96JQ5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
MS4A4AQ96JQ5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
MS4A4AQ96JQ5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
MS4A4AQ96JQ5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
MS4A4AQ96JQ5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
MS4A4AQ96JQ5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
MS4A4AQ96JQ5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
MS4A4AQ96JQ5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
MS4A4AQ96JQ5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
MS4A4AQ96JQ5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
MS4A4AQ96JQ5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
MS4A4AQ96JQ5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
MS4A4AQ96JQ5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
MS4A4AQ96JQ5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
MS4A4AQ96JQ5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
MS4A4AQ96JQ5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
MS4A4AQ96JQ5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
MS4A4AQ96JQ5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
MS4A4AQ96JQ5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
MS4A4AQ96JQ5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
MS4A4AQ96JQ5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
MS4A4AQ96JQ5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
MS4A4AQ96JQ5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
MS4A4AQ96JQ5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
MS4A4AQ96JQ5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
MS4A4AQ96JQ5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
MS4A4AQ96JQ5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
MS4A4AQ96JQ5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
MS4A4AQ96JQ5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
MS4A4AQ96JQ5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
MS4A4AQ96JQ5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
MS4A4AQ96JQ5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
MS4A4AQ96JQ5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
MS4A4AQ96JQ5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
MS4A4AQ96JQ5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
MS4A4AQ96JQ5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
MS4A4AQ96JQ5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
MS4A4AQ96JQ5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
MS4A4AQ96JQ5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
MS4A4AQ96JQ5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
MS4A4AQ96JQ5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
MS4A4AQ96JQ5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
MS4A4AQ96JQ5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
MS4A4AQ96JQ5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
MS4A4AQ96JQ5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
MS4A4AQ96JQ5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
MS4A4AQ96JQ5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
MS4A4AQ96JQ5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
MS4A4AQ96JQ5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
MS4A4AQ96JQ5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
MS4A4AQ96JQ5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
MS4A4AQ96JQ5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
MS4A4AQ96JQ5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
MS4A4AQ96JQ5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
MS4A4AQ96JQ5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
MS4A4AQ96JQ5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
MS4A4AQ96JQ5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
MS4A4AQ96JQ5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
MS4A4AQ96JQ5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
MS4A4AQ96JQ5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
MS4A4AQ96JQ5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
MS4A4AQ96JQ5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
MS4A4AQ96JQ5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
MS4A4AQ96JQ5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
MS4A4AQ96JQ5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
MS4A4AQ96JQ5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
MS4A4AQ96JQ5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
MS4A4AQ96JQ5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
MS4A4AQ96JQ5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
MS4A4AQ96JQ5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
MS4A4AQ96JQ5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
MS4A4AQ96JQ5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms