Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ5

CLIP3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP3Q96DZ5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLIP3Q96DZ5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLIP3Q96DZ5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLIP3Q96DZ5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLIP3Q96DZ5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLIP3Q96DZ5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLIP3Q96DZ5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLIP3Q96DZ5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLIP3Q96DZ5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLIP3Q96DZ5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLIP3Q96DZ5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLIP3Q96DZ5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLIP3Q96DZ5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLIP3Q96DZ5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLIP3Q96DZ5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLIP3Q96DZ5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLIP3Q96DZ5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLIP3Q96DZ5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLIP3Q96DZ5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLIP3Q96DZ5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLIP3Q96DZ5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLIP3Q96DZ5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CLIP3Q96DZ5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLIP3Q96DZ5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLIP3Q96DZ5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLIP3Q96DZ5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CLIP3Q96DZ5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLIP3Q96DZ5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLIP3Q96DZ5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLIP3Q96DZ5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIP3Q96DZ5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIP3Q96DZ5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLIP3Q96DZ5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLIP3Q96DZ5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLIP3Q96DZ5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLIP3Q96DZ5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLIP3Q96DZ5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CLIP3Q96DZ5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLIP3Q96DZ5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLIP3Q96DZ5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLIP3Q96DZ5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLIP3Q96DZ5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLIP3Q96DZ5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLIP3Q96DZ5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CLIP3Q96DZ5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLIP3Q96DZ5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLIP3Q96DZ5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLIP3Q96DZ5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLIP3Q96DZ5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLIP3Q96DZ5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLIP3Q96DZ5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLIP3Q96DZ5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLIP3Q96DZ5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLIP3Q96DZ5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLIP3Q96DZ5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CLIP3Q96DZ5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLIP3Q96DZ5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLIP3Q96DZ5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLIP3Q96DZ5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLIP3Q96DZ5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLIP3Q96DZ5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLIP3Q96DZ5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLIP3Q96DZ5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLIP3Q96DZ5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CLIP3Q96DZ5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLIP3Q96DZ5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLIP3Q96DZ5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLIP3Q96DZ5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLIP3Q96DZ5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLIP3Q96DZ5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLIP3Q96DZ5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLIP3Q96DZ5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLIP3Q96DZ5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLIP3Q96DZ5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLIP3Q96DZ5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLIP3Q96DZ5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLIP3Q96DZ5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLIP3Q96DZ5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CLIP3Q96DZ5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLIP3Q96DZ5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLIP3Q96DZ5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLIP3Q96DZ5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CLIP3Q96DZ5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLIP3Q96DZ5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLIP3Q96DZ5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLIP3Q96DZ5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CLIP3Q96DZ5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CLIP3Q96DZ5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLIP3Q96DZ5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLIP3Q96DZ5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLIP3Q96DZ5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLIP3Q96DZ5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLIP3Q96DZ5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLIP3Q96DZ5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CLIP3Q96DZ5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLIP3Q96DZ5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIP3Q96DZ5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIP3Q96DZ5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIP3Q96DZ5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIP3Q96DZ5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms