Protein–RNA interactions for Protein: Q92583

CCL17, C-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL17Q92583 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCL17Q92583 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCL17Q92583 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCL17Q92583 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCL17Q92583 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCL17Q92583 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCL17Q92583 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCL17Q92583 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCL17Q92583 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCL17Q92583 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCL17Q92583 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCL17Q92583 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCL17Q92583 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCL17Q92583 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCL17Q92583 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCL17Q92583 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCL17Q92583 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCL17Q92583 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCL17Q92583 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCL17Q92583 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCL17Q92583 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCL17Q92583 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCL17Q92583 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCL17Q92583 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCL17Q92583 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCL17Q92583 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCL17Q92583 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCL17Q92583 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCL17Q92583 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCL17Q92583 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL17Q92583 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL17Q92583 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL17Q92583 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL17Q92583 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL17Q92583 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL17Q92583 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL17Q92583 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCL17Q92583 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCL17Q92583 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCL17Q92583 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCL17Q92583 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCL17Q92583 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCL17Q92583 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCL17Q92583 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCL17Q92583 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCL17Q92583 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCL17Q92583 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCL17Q92583 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCL17Q92583 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCL17Q92583 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCL17Q92583 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCL17Q92583 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCL17Q92583 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCL17Q92583 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCL17Q92583 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCL17Q92583 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCL17Q92583 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCL17Q92583 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCL17Q92583 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCL17Q92583 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCL17Q92583 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCL17Q92583 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCL17Q92583 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCL17Q92583 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCL17Q92583 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCL17Q92583 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCL17Q92583 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCL17Q92583 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCL17Q92583 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCL17Q92583 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCL17Q92583 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCL17Q92583 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL17Q92583 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL17Q92583 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL17Q92583 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCL17Q92583 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCL17Q92583 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCL17Q92583 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCL17Q92583 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCL17Q92583 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCL17Q92583 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCL17Q92583 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCL17Q92583 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCL17Q92583 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCL17Q92583 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCL17Q92583 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCL17Q92583 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCL17Q92583 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCL17Q92583 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCL17Q92583 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCL17Q92583 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCL17Q92583 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCL17Q92583 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCL17Q92583 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCL17Q92583 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCL17Q92583 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCL17Q92583 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCL17Q92583 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL17Q92583 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL17Q92583 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms