Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF3Q92576 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHF3Q92576 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHF3Q92576 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHF3Q92576 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHF3Q92576 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHF3Q92576 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHF3Q92576 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHF3Q92576 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHF3Q92576 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHF3Q92576 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHF3Q92576 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHF3Q92576 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHF3Q92576 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHF3Q92576 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHF3Q92576 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHF3Q92576 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHF3Q92576 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHF3Q92576 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHF3Q92576 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHF3Q92576 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHF3Q92576 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHF3Q92576 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHF3Q92576 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHF3Q92576 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHF3Q92576 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PHF3Q92576 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHF3Q92576 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHF3Q92576 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHF3Q92576 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PHF3Q92576 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PHF3Q92576 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PHF3Q92576 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHF3Q92576 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHF3Q92576 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHF3Q92576 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PHF3Q92576 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHF3Q92576 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHF3Q92576 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PHF3Q92576 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHF3Q92576 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHF3Q92576 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHF3Q92576 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PHF3Q92576 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHF3Q92576 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHF3Q92576 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHF3Q92576 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHF3Q92576 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHF3Q92576 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHF3Q92576 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHF3Q92576 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PHF3Q92576 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHF3Q92576 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHF3Q92576 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHF3Q92576 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PHF3Q92576 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHF3Q92576 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHF3Q92576 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHF3Q92576 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHF3Q92576 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHF3Q92576 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHF3Q92576 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHF3Q92576 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHF3Q92576 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHF3Q92576 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHF3Q92576 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHF3Q92576 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHF3Q92576 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHF3Q92576 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHF3Q92576 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHF3Q92576 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHF3Q92576 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHF3Q92576 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHF3Q92576 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHF3Q92576 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHF3Q92576 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHF3Q92576 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHF3Q92576 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHF3Q92576 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF3Q92576 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF3Q92576 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF3Q92576 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF3Q92576 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF3Q92576 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF3Q92576 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF3Q92576 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF3Q92576 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHF3Q92576 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHF3Q92576 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF3Q92576 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF3Q92576 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHF3Q92576 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF3Q92576 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF3Q92576 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF3Q92576 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF3Q92576 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHF3Q92576 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHF3Q92576 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHF3Q92576 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHF3Q92576 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms