Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN0

ATG4A, Cysteine protease ATG4A, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4AQ8WYN0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATG4AQ8WYN0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATG4AQ8WYN0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATG4AQ8WYN0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATG4AQ8WYN0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATG4AQ8WYN0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATG4AQ8WYN0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATG4AQ8WYN0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATG4AQ8WYN0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATG4AQ8WYN0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATG4AQ8WYN0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATG4AQ8WYN0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATG4AQ8WYN0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATG4AQ8WYN0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATG4AQ8WYN0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATG4AQ8WYN0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATG4AQ8WYN0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATG4AQ8WYN0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATG4AQ8WYN0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATG4AQ8WYN0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATG4AQ8WYN0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ATG4AQ8WYN0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATG4AQ8WYN0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATG4AQ8WYN0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATG4AQ8WYN0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATG4AQ8WYN0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATG4AQ8WYN0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATG4AQ8WYN0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATG4AQ8WYN0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATG4AQ8WYN0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATG4AQ8WYN0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATG4AQ8WYN0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATG4AQ8WYN0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATG4AQ8WYN0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATG4AQ8WYN0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATG4AQ8WYN0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ATG4AQ8WYN0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATG4AQ8WYN0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATG4AQ8WYN0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATG4AQ8WYN0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATG4AQ8WYN0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ATG4AQ8WYN0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATG4AQ8WYN0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATG4AQ8WYN0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATG4AQ8WYN0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATG4AQ8WYN0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATG4AQ8WYN0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATG4AQ8WYN0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATG4AQ8WYN0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATG4AQ8WYN0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATG4AQ8WYN0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATG4AQ8WYN0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATG4AQ8WYN0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATG4AQ8WYN0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
ATG4AQ8WYN0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATG4AQ8WYN0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATG4AQ8WYN0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATG4AQ8WYN0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATG4AQ8WYN0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATG4AQ8WYN0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATG4AQ8WYN0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATG4AQ8WYN0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ATG4AQ8WYN0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATG4AQ8WYN0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATG4AQ8WYN0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATG4AQ8WYN0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATG4AQ8WYN0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATG4AQ8WYN0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATG4AQ8WYN0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATG4AQ8WYN0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATG4AQ8WYN0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ATG4AQ8WYN0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ATG4AQ8WYN0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ATG4AQ8WYN0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATG4AQ8WYN0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATG4AQ8WYN0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATG4AQ8WYN0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATG4AQ8WYN0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATG4AQ8WYN0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATG4AQ8WYN0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATG4AQ8WYN0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATG4AQ8WYN0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATG4AQ8WYN0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATG4AQ8WYN0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATG4AQ8WYN0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATG4AQ8WYN0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATG4AQ8WYN0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATG4AQ8WYN0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATG4AQ8WYN0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATG4AQ8WYN0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATG4AQ8WYN0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATG4AQ8WYN0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATG4AQ8WYN0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ATG4AQ8WYN0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATG4AQ8WYN0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ATG4AQ8WYN0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATG4AQ8WYN0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATG4AQ8WYN0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATG4AQ8WYN0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATG4AQ8WYN0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms