Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE0

CASKIN2, Caskin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN2Q8WXE0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CASKIN2Q8WXE0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CASKIN2Q8WXE0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CASKIN2Q8WXE0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CASKIN2Q8WXE0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CASKIN2Q8WXE0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CASKIN2Q8WXE0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CASKIN2Q8WXE0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CASKIN2Q8WXE0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CASKIN2Q8WXE0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CASKIN2Q8WXE0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CASKIN2Q8WXE0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CASKIN2Q8WXE0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CASKIN2Q8WXE0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CASKIN2Q8WXE0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CASKIN2Q8WXE0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CASKIN2Q8WXE0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CASKIN2Q8WXE0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CASKIN2Q8WXE0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CASKIN2Q8WXE0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CASKIN2Q8WXE0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CASKIN2Q8WXE0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CASKIN2Q8WXE0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CASKIN2Q8WXE0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CASKIN2Q8WXE0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CASKIN2Q8WXE0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CASKIN2Q8WXE0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CASKIN2Q8WXE0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CASKIN2Q8WXE0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CASKIN2Q8WXE0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CASKIN2Q8WXE0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CASKIN2Q8WXE0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CASKIN2Q8WXE0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CASKIN2Q8WXE0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CASKIN2Q8WXE0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CASKIN2Q8WXE0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CASKIN2Q8WXE0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CASKIN2Q8WXE0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CASKIN2Q8WXE0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CASKIN2Q8WXE0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CASKIN2Q8WXE0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CASKIN2Q8WXE0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CASKIN2Q8WXE0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CASKIN2Q8WXE0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CASKIN2Q8WXE0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CASKIN2Q8WXE0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CASKIN2Q8WXE0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CASKIN2Q8WXE0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CASKIN2Q8WXE0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CASKIN2Q8WXE0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CASKIN2Q8WXE0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CASKIN2Q8WXE0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CASKIN2Q8WXE0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CASKIN2Q8WXE0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CASKIN2Q8WXE0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CASKIN2Q8WXE0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CASKIN2Q8WXE0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CASKIN2Q8WXE0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CASKIN2Q8WXE0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CASKIN2Q8WXE0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASKIN2Q8WXE0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CASKIN2Q8WXE0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CASKIN2Q8WXE0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CASKIN2Q8WXE0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CASKIN2Q8WXE0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CASKIN2Q8WXE0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CASKIN2Q8WXE0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CASKIN2Q8WXE0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CASKIN2Q8WXE0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CASKIN2Q8WXE0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CASKIN2Q8WXE0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CASKIN2Q8WXE0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CASKIN2Q8WXE0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CASKIN2Q8WXE0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CASKIN2Q8WXE0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CASKIN2Q8WXE0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CASKIN2Q8WXE0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CASKIN2Q8WXE0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CASKIN2Q8WXE0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CASKIN2Q8WXE0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CASKIN2Q8WXE0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CASKIN2Q8WXE0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CASKIN2Q8WXE0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CASKIN2Q8WXE0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CASKIN2Q8WXE0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CASKIN2Q8WXE0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CASKIN2Q8WXE0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CASKIN2Q8WXE0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CASKIN2Q8WXE0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CASKIN2Q8WXE0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CASKIN2Q8WXE0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CASKIN2Q8WXE0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CASKIN2Q8WXE0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CASKIN2Q8WXE0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CASKIN2Q8WXE0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CASKIN2Q8WXE0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CASKIN2Q8WXE0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CASKIN2Q8WXE0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CASKIN2Q8WXE0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CASKIN2Q8WXE0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms