Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVP5

TNFAIP8L1, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP8L1Q8WVP5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFAIP8L1Q8WVP5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFAIP8L1Q8WVP5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFAIP8L1Q8WVP5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFAIP8L1Q8WVP5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFAIP8L1Q8WVP5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFAIP8L1Q8WVP5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFAIP8L1Q8WVP5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFAIP8L1Q8WVP5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFAIP8L1Q8WVP5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFAIP8L1Q8WVP5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFAIP8L1Q8WVP5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNFAIP8L1Q8WVP5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNFAIP8L1Q8WVP5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFAIP8L1Q8WVP5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFAIP8L1Q8WVP5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFAIP8L1Q8WVP5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFAIP8L1Q8WVP5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFAIP8L1Q8WVP5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFAIP8L1Q8WVP5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFAIP8L1Q8WVP5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFAIP8L1Q8WVP5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFAIP8L1Q8WVP5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFAIP8L1Q8WVP5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFAIP8L1Q8WVP5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFAIP8L1Q8WVP5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFAIP8L1Q8WVP5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFAIP8L1Q8WVP5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFAIP8L1Q8WVP5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFAIP8L1Q8WVP5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFAIP8L1Q8WVP5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFAIP8L1Q8WVP5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFAIP8L1Q8WVP5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFAIP8L1Q8WVP5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNFAIP8L1Q8WVP5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFAIP8L1Q8WVP5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFAIP8L1Q8WVP5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNFAIP8L1Q8WVP5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFAIP8L1Q8WVP5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFAIP8L1Q8WVP5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFAIP8L1Q8WVP5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFAIP8L1Q8WVP5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFAIP8L1Q8WVP5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFAIP8L1Q8WVP5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFAIP8L1Q8WVP5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFAIP8L1Q8WVP5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFAIP8L1Q8WVP5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFAIP8L1Q8WVP5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFAIP8L1Q8WVP5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFAIP8L1Q8WVP5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFAIP8L1Q8WVP5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFAIP8L1Q8WVP5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFAIP8L1Q8WVP5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFAIP8L1Q8WVP5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFAIP8L1Q8WVP5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFAIP8L1Q8WVP5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFAIP8L1Q8WVP5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFAIP8L1Q8WVP5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFAIP8L1Q8WVP5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFAIP8L1Q8WVP5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFAIP8L1Q8WVP5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFAIP8L1Q8WVP5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFAIP8L1Q8WVP5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFAIP8L1Q8WVP5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFAIP8L1Q8WVP5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFAIP8L1Q8WVP5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFAIP8L1Q8WVP5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFAIP8L1Q8WVP5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFAIP8L1Q8WVP5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFAIP8L1Q8WVP5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFAIP8L1Q8WVP5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFAIP8L1Q8WVP5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFAIP8L1Q8WVP5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFAIP8L1Q8WVP5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFAIP8L1Q8WVP5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFAIP8L1Q8WVP5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFAIP8L1Q8WVP5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFAIP8L1Q8WVP5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFAIP8L1Q8WVP5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFAIP8L1Q8WVP5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFAIP8L1Q8WVP5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFAIP8L1Q8WVP5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFAIP8L1Q8WVP5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFAIP8L1Q8WVP5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFAIP8L1Q8WVP5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFAIP8L1Q8WVP5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFAIP8L1Q8WVP5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFAIP8L1Q8WVP5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNFAIP8L1Q8WVP5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNFAIP8L1Q8WVP5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFAIP8L1Q8WVP5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFAIP8L1Q8WVP5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFAIP8L1Q8WVP5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFAIP8L1Q8WVP5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFAIP8L1Q8WVP5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFAIP8L1Q8WVP5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFAIP8L1Q8WVP5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFAIP8L1Q8WVP5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFAIP8L1Q8WVP5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFAIP8L1Q8WVP5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms