Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD1

RAB2B, Ras-related protein Rab-2B, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2BQ8WUD1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB2BQ8WUD1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB2BQ8WUD1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB2BQ8WUD1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB2BQ8WUD1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB2BQ8WUD1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB2BQ8WUD1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB2BQ8WUD1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB2BQ8WUD1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB2BQ8WUD1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB2BQ8WUD1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB2BQ8WUD1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB2BQ8WUD1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB2BQ8WUD1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB2BQ8WUD1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB2BQ8WUD1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB2BQ8WUD1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB2BQ8WUD1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB2BQ8WUD1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB2BQ8WUD1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB2BQ8WUD1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB2BQ8WUD1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB2BQ8WUD1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB2BQ8WUD1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB2BQ8WUD1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB2BQ8WUD1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB2BQ8WUD1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB2BQ8WUD1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB2BQ8WUD1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB2BQ8WUD1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB2BQ8WUD1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB2BQ8WUD1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB2BQ8WUD1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB2BQ8WUD1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB2BQ8WUD1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB2BQ8WUD1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB2BQ8WUD1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB2BQ8WUD1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB2BQ8WUD1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB2BQ8WUD1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB2BQ8WUD1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB2BQ8WUD1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RAB2BQ8WUD1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB2BQ8WUD1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB2BQ8WUD1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB2BQ8WUD1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB2BQ8WUD1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB2BQ8WUD1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB2BQ8WUD1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB2BQ8WUD1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB2BQ8WUD1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB2BQ8WUD1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB2BQ8WUD1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB2BQ8WUD1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB2BQ8WUD1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB2BQ8WUD1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB2BQ8WUD1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB2BQ8WUD1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB2BQ8WUD1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB2BQ8WUD1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB2BQ8WUD1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB2BQ8WUD1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB2BQ8WUD1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB2BQ8WUD1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAB2BQ8WUD1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB2BQ8WUD1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB2BQ8WUD1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB2BQ8WUD1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB2BQ8WUD1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RAB2BQ8WUD1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB2BQ8WUD1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB2BQ8WUD1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB2BQ8WUD1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB2BQ8WUD1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB2BQ8WUD1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB2BQ8WUD1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB2BQ8WUD1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB2BQ8WUD1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB2BQ8WUD1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB2BQ8WUD1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB2BQ8WUD1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB2BQ8WUD1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB2BQ8WUD1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB2BQ8WUD1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB2BQ8WUD1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB2BQ8WUD1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB2BQ8WUD1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB2BQ8WUD1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB2BQ8WUD1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB2BQ8WUD1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB2BQ8WUD1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB2BQ8WUD1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB2BQ8WUD1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RAB2BQ8WUD1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB2BQ8WUD1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB2BQ8WUD1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB2BQ8WUD1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB2BQ8WUD1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB2BQ8WUD1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB2BQ8WUD1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms