Protein–RNA interactions for Protein: Q8TER5

ARHGEF40, Rho guanine nucleotide exchange factor 40, humanhuman

Predictions only

Length 1,519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF40Q8TER5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.2■■■■■ 4.51
ARHGEF40Q8TER5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
ARHGEF40Q8TER5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC43.15■■■■■ 4.5
ARHGEF40Q8TER5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC43.14■■■■■ 4.5
ARHGEF40Q8TER5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
ARHGEF40Q8TER5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC43.13■■■■■ 4.5
ARHGEF40Q8TER5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC43.1■■■■■ 4.49
ARHGEF40Q8TER5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC43.1■■■■■ 4.49
ARHGEF40Q8TER5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC43.1■■■■■ 4.49
ARHGEF40Q8TER5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC43.08■■■■■ 4.49
ARHGEF40Q8TER5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC43.07■■■■■ 4.49
ARHGEF40Q8TER5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
ARHGEF40Q8TER5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC43.07■■■■■ 4.48
ARHGEF40Q8TER5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC43.05■■■■■ 4.48
ARHGEF40Q8TER5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
ARHGEF40Q8TER5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC43.02■■■■■ 4.48
ARHGEF40Q8TER5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
ARHGEF40Q8TER5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.02■■■■■ 4.48
ARHGEF40Q8TER5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
ARHGEF40Q8TER5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
ARHGEF40Q8TER5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC42.99■■■■■ 4.47
ARHGEF40Q8TER5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.97■■■■■ 4.47
ARHGEF40Q8TER5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC42.95■■■■■ 4.47
ARHGEF40Q8TER5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC42.95■■■■■ 4.47
ARHGEF40Q8TER5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.94■■■■■ 4.46
ARHGEF40Q8TER5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
ARHGEF40Q8TER5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC42.9■■■■■ 4.46
ARHGEF40Q8TER5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC42.87■■■■■ 4.45
ARHGEF40Q8TER5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.86■■■■■ 4.45
ARHGEF40Q8TER5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC42.86■■■■■ 4.45
ARHGEF40Q8TER5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC42.81■■■■■ 4.44
ARHGEF40Q8TER5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC42.8■■■■■ 4.44
ARHGEF40Q8TER5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.8■■■■■ 4.44
ARHGEF40Q8TER5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.8■■■■■ 4.44
ARHGEF40Q8TER5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.8■■■■■ 4.44
ARHGEF40Q8TER5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC42.8■■■■■ 4.44
ARHGEF40Q8TER5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
ARHGEF40Q8TER5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
ARHGEF40Q8TER5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.73■■■■■ 4.43
ARHGEF40Q8TER5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC42.71■■■■■ 4.43
ARHGEF40Q8TER5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.67■■■■■ 4.42
ARHGEF40Q8TER5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
ARHGEF40Q8TER5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
ARHGEF40Q8TER5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC42.65■■■■■ 4.42
ARHGEF40Q8TER5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
ARHGEF40Q8TER5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
ARHGEF40Q8TER5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
ARHGEF40Q8TER5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC42.63■■■■■ 4.42
ARHGEF40Q8TER5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC42.61■■■■■ 4.41
ARHGEF40Q8TER5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC42.6■■■■■ 4.41
ARHGEF40Q8TER5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
ARHGEF40Q8TER5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC42.59■■■■■ 4.41
ARHGEF40Q8TER5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC42.58■■■■■ 4.41
ARHGEF40Q8TER5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC42.57■■■■■ 4.41
ARHGEF40Q8TER5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC42.57■■■■■ 4.41
ARHGEF40Q8TER5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC42.57■■■■■ 4.4
ARHGEF40Q8TER5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
ARHGEF40Q8TER5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
ARHGEF40Q8TER5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC42.52■■■■■ 4.4
ARHGEF40Q8TER5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC42.52■■■■■ 4.4
ARHGEF40Q8TER5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
ARHGEF40Q8TER5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.45■■■■■ 4.39
ARHGEF40Q8TER5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC42.42■■■■■ 4.38
ARHGEF40Q8TER5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
ARHGEF40Q8TER5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
ARHGEF40Q8TER5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC42.41■■■■■ 4.38
ARHGEF40Q8TER5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC42.4■■■■■ 4.38
ARHGEF40Q8TER5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC42.39■■■■■ 4.38
ARHGEF40Q8TER5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC42.39■■■■■ 4.38
ARHGEF40Q8TER5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC42.39■■■■■ 4.38
ARHGEF40Q8TER5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC42.36■■■■■ 4.37
ARHGEF40Q8TER5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
ARHGEF40Q8TER5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
ARHGEF40Q8TER5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
ARHGEF40Q8TER5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
ARHGEF40Q8TER5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
ARHGEF40Q8TER5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC42.3■■■■■ 4.36
ARHGEF40Q8TER5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC42.3■■■■■ 4.36
ARHGEF40Q8TER5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.3■■■■■ 4.36
ARHGEF40Q8TER5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.3■■■■■ 4.36
ARHGEF40Q8TER5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
ARHGEF40Q8TER5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC42.29■■■■■ 4.36
ARHGEF40Q8TER5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
ARHGEF40Q8TER5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
ARHGEF40Q8TER5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC42.26■■■■■ 4.36
ARHGEF40Q8TER5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
ARHGEF40Q8TER5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
ARHGEF40Q8TER5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
ARHGEF40Q8TER5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
ARHGEF40Q8TER5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
ARHGEF40Q8TER5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC42.14■■■■■ 4.34
ARHGEF40Q8TER5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC42.14■■■■■ 4.34
ARHGEF40Q8TER5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC42.13■■■■■ 4.33
ARHGEF40Q8TER5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.12■■■■■ 4.33
ARHGEF40Q8TER5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC42.1■■■■■ 4.33
ARHGEF40Q8TER5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
ARHGEF40Q8TER5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
ARHGEF40Q8TER5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
ARHGEF40Q8TER5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC42.07■■■■■ 4.33
ARHGEF40Q8TER5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
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