Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI8

TMC1, Transmembrane channel-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC1Q8TDI8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
TMC1Q8TDI8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
TMC1Q8TDI8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
TMC1Q8TDI8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC38.83■■■■□ 3.81
TMC1Q8TDI8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
TMC1Q8TDI8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
TMC1Q8TDI8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
TMC1Q8TDI8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
TMC1Q8TDI8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
TMC1Q8TDI8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
TMC1Q8TDI8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
TMC1Q8TDI8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
TMC1Q8TDI8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.74■■■■□ 3.79
TMC1Q8TDI8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
TMC1Q8TDI8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
TMC1Q8TDI8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
TMC1Q8TDI8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
TMC1Q8TDI8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
TMC1Q8TDI8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
TMC1Q8TDI8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
TMC1Q8TDI8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
TMC1Q8TDI8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
TMC1Q8TDI8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
TMC1Q8TDI8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
TMC1Q8TDI8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
TMC1Q8TDI8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
TMC1Q8TDI8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
TMC1Q8TDI8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
TMC1Q8TDI8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
TMC1Q8TDI8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
TMC1Q8TDI8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC38.55■■■■□ 3.76
TMC1Q8TDI8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.55■■■■□ 3.76
TMC1Q8TDI8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
TMC1Q8TDI8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
TMC1Q8TDI8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
TMC1Q8TDI8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
TMC1Q8TDI8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
TMC1Q8TDI8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
TMC1Q8TDI8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
TMC1Q8TDI8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
TMC1Q8TDI8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
TMC1Q8TDI8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
TMC1Q8TDI8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
TMC1Q8TDI8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
TMC1Q8TDI8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
TMC1Q8TDI8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
TMC1Q8TDI8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
TMC1Q8TDI8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
TMC1Q8TDI8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
TMC1Q8TDI8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
TMC1Q8TDI8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC38.35■■■■□ 3.73
TMC1Q8TDI8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
TMC1Q8TDI8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
TMC1Q8TDI8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
TMC1Q8TDI8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
TMC1Q8TDI8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
TMC1Q8TDI8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC38.26■■■■□ 3.71
TMC1Q8TDI8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
TMC1Q8TDI8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
TMC1Q8TDI8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
TMC1Q8TDI8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
TMC1Q8TDI8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
TMC1Q8TDI8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
TMC1Q8TDI8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
TMC1Q8TDI8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC38.18■■■■□ 3.7
TMC1Q8TDI8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
TMC1Q8TDI8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC38.17■■■■□ 3.7
TMC1Q8TDI8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
TMC1Q8TDI8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
TMC1Q8TDI8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
TMC1Q8TDI8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.7
TMC1Q8TDI8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
TMC1Q8TDI8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
TMC1Q8TDI8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.07■■■■□ 3.69
TMC1Q8TDI8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
TMC1Q8TDI8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
TMC1Q8TDI8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
TMC1Q8TDI8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
TMC1Q8TDI8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
TMC1Q8TDI8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
TMC1Q8TDI8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
TMC1Q8TDI8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
TMC1Q8TDI8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
TMC1Q8TDI8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
TMC1Q8TDI8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
TMC1Q8TDI8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
TMC1Q8TDI8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
TMC1Q8TDI8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
TMC1Q8TDI8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
TMC1Q8TDI8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
TMC1Q8TDI8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
TMC1Q8TDI8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
TMC1Q8TDI8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
TMC1Q8TDI8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC37.95■■■■□ 3.67
TMC1Q8TDI8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
TMC1Q8TDI8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.66
TMC1Q8TDI8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
TMC1Q8TDI8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
TMC1Q8TDI8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
TMC1Q8TDI8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms