Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
HELQQ8TDG4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
HELQQ8TDG4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
HELQQ8TDG4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
HELQQ8TDG4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
HELQQ8TDG4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
HELQQ8TDG4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
HELQQ8TDG4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
HELQQ8TDG4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
HELQQ8TDG4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
HELQQ8TDG4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
HELQQ8TDG4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HELQQ8TDG4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HELQQ8TDG4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
HELQQ8TDG4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
HELQQ8TDG4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
HELQQ8TDG4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
HELQQ8TDG4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
HELQQ8TDG4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
HELQQ8TDG4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
HELQQ8TDG4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
HELQQ8TDG4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HELQQ8TDG4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HELQQ8TDG4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HELQQ8TDG4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
HELQQ8TDG4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HELQQ8TDG4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HELQQ8TDG4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HELQQ8TDG4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HELQQ8TDG4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
HELQQ8TDG4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
HELQQ8TDG4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
HELQQ8TDG4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
HELQQ8TDG4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
HELQQ8TDG4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
HELQQ8TDG4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
HELQQ8TDG4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
HELQQ8TDG4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
HELQQ8TDG4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
HELQQ8TDG4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
HELQQ8TDG4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
HELQQ8TDG4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
HELQQ8TDG4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
HELQQ8TDG4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
HELQQ8TDG4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
HELQQ8TDG4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
HELQQ8TDG4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
HELQQ8TDG4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
HELQQ8TDG4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
HELQQ8TDG4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
HELQQ8TDG4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
HELQQ8TDG4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
HELQQ8TDG4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
HELQQ8TDG4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
HELQQ8TDG4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HELQQ8TDG4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
HELQQ8TDG4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
HELQQ8TDG4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
HELQQ8TDG4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
HELQQ8TDG4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HELQQ8TDG4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
HELQQ8TDG4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
HELQQ8TDG4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HELQQ8TDG4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
HELQQ8TDG4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
HELQQ8TDG4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
HELQQ8TDG4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HELQQ8TDG4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HELQQ8TDG4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
HELQQ8TDG4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
HELQQ8TDG4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
HELQQ8TDG4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
HELQQ8TDG4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
HELQQ8TDG4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
HELQQ8TDG4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HELQQ8TDG4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
HELQQ8TDG4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
HELQQ8TDG4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
HELQQ8TDG4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
HELQQ8TDG4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
HELQQ8TDG4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
HELQQ8TDG4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
HELQQ8TDG4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
HELQQ8TDG4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HELQQ8TDG4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HELQQ8TDG4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
HELQQ8TDG4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
HELQQ8TDG4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
HELQQ8TDG4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
HELQQ8TDG4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30■■■□□ 2.39
HELQQ8TDG4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HELQQ8TDG4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
HELQQ8TDG4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
HELQQ8TDG4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
HELQQ8TDG4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HELQQ8TDG4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
HELQQ8TDG4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
HELQQ8TDG4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HELQQ8TDG4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
HELQQ8TDG4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms