Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHS1

CLDND2, Claudin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND2Q8NHS1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDND2Q8NHS1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDND2Q8NHS1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDND2Q8NHS1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDND2Q8NHS1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDND2Q8NHS1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDND2Q8NHS1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDND2Q8NHS1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDND2Q8NHS1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDND2Q8NHS1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDND2Q8NHS1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDND2Q8NHS1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDND2Q8NHS1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDND2Q8NHS1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDND2Q8NHS1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDND2Q8NHS1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDND2Q8NHS1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLDND2Q8NHS1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDND2Q8NHS1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDND2Q8NHS1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDND2Q8NHS1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDND2Q8NHS1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDND2Q8NHS1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDND2Q8NHS1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDND2Q8NHS1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDND2Q8NHS1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDND2Q8NHS1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDND2Q8NHS1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDND2Q8NHS1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDND2Q8NHS1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDND2Q8NHS1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDND2Q8NHS1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDND2Q8NHS1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDND2Q8NHS1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDND2Q8NHS1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDND2Q8NHS1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDND2Q8NHS1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDND2Q8NHS1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDND2Q8NHS1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDND2Q8NHS1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDND2Q8NHS1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDND2Q8NHS1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDND2Q8NHS1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDND2Q8NHS1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDND2Q8NHS1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDND2Q8NHS1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDND2Q8NHS1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDND2Q8NHS1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDND2Q8NHS1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDND2Q8NHS1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDND2Q8NHS1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDND2Q8NHS1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDND2Q8NHS1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDND2Q8NHS1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDND2Q8NHS1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDND2Q8NHS1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDND2Q8NHS1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDND2Q8NHS1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDND2Q8NHS1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDND2Q8NHS1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDND2Q8NHS1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDND2Q8NHS1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDND2Q8NHS1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDND2Q8NHS1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDND2Q8NHS1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDND2Q8NHS1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLDND2Q8NHS1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLDND2Q8NHS1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLDND2Q8NHS1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLDND2Q8NHS1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDND2Q8NHS1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDND2Q8NHS1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDND2Q8NHS1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDND2Q8NHS1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDND2Q8NHS1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDND2Q8NHS1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDND2Q8NHS1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDND2Q8NHS1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDND2Q8NHS1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDND2Q8NHS1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDND2Q8NHS1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDND2Q8NHS1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDND2Q8NHS1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDND2Q8NHS1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDND2Q8NHS1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDND2Q8NHS1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDND2Q8NHS1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDND2Q8NHS1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDND2Q8NHS1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDND2Q8NHS1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDND2Q8NHS1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDND2Q8NHS1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDND2Q8NHS1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLDND2Q8NHS1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLDND2Q8NHS1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDND2Q8NHS1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDND2Q8NHS1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDND2Q8NHS1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDND2Q8NHS1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDND2Q8NHS1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms