Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
BEST2Q8NFU1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
BEST2Q8NFU1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
BEST2Q8NFU1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BEST2Q8NFU1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
BEST2Q8NFU1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
BEST2Q8NFU1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
BEST2Q8NFU1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
BEST2Q8NFU1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
BEST2Q8NFU1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
BEST2Q8NFU1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
BEST2Q8NFU1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
BEST2Q8NFU1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
BEST2Q8NFU1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
BEST2Q8NFU1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
BEST2Q8NFU1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
BEST2Q8NFU1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
BEST2Q8NFU1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
BEST2Q8NFU1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
BEST2Q8NFU1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BEST2Q8NFU1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
BEST2Q8NFU1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
BEST2Q8NFU1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
BEST2Q8NFU1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
BEST2Q8NFU1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
BEST2Q8NFU1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
BEST2Q8NFU1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
BEST2Q8NFU1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
BEST2Q8NFU1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
BEST2Q8NFU1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
BEST2Q8NFU1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BEST2Q8NFU1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BEST2Q8NFU1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BEST2Q8NFU1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BEST2Q8NFU1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
BEST2Q8NFU1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
BEST2Q8NFU1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
BEST2Q8NFU1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
BEST2Q8NFU1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BEST2Q8NFU1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
BEST2Q8NFU1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
BEST2Q8NFU1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
BEST2Q8NFU1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BEST2Q8NFU1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
BEST2Q8NFU1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
BEST2Q8NFU1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
BEST2Q8NFU1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
BEST2Q8NFU1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
BEST2Q8NFU1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
BEST2Q8NFU1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
BEST2Q8NFU1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
BEST2Q8NFU1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
BEST2Q8NFU1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
BEST2Q8NFU1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
BEST2Q8NFU1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
BEST2Q8NFU1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
BEST2Q8NFU1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
BEST2Q8NFU1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BEST2Q8NFU1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BEST2Q8NFU1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
BEST2Q8NFU1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BEST2Q8NFU1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
BEST2Q8NFU1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
BEST2Q8NFU1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
BEST2Q8NFU1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BEST2Q8NFU1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BEST2Q8NFU1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BEST2Q8NFU1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BEST2Q8NFU1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BEST2Q8NFU1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
BEST2Q8NFU1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
BEST2Q8NFU1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
BEST2Q8NFU1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BEST2Q8NFU1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BEST2Q8NFU1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
BEST2Q8NFU1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
BEST2Q8NFU1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
BEST2Q8NFU1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BEST2Q8NFU1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BEST2Q8NFU1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
BEST2Q8NFU1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
BEST2Q8NFU1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
BEST2Q8NFU1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BEST2Q8NFU1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BEST2Q8NFU1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BEST2Q8NFU1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BEST2Q8NFU1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BEST2Q8NFU1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
BEST2Q8NFU1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
BEST2Q8NFU1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
BEST2Q8NFU1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
BEST2Q8NFU1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
BEST2Q8NFU1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
BEST2Q8NFU1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
BEST2Q8NFU1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
BEST2Q8NFU1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
BEST2Q8NFU1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
BEST2Q8NFU1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
BEST2Q8NFU1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
BEST2Q8NFU1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms