Protein–RNA interactions for Protein: Q8NER5

ACVR1C, Activin receptor type-1C, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1CQ8NER5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ACVR1CQ8NER5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ACVR1CQ8NER5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ACVR1CQ8NER5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ACVR1CQ8NER5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ACVR1CQ8NER5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ACVR1CQ8NER5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ACVR1CQ8NER5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ACVR1CQ8NER5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ACVR1CQ8NER5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ACVR1CQ8NER5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ACVR1CQ8NER5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ACVR1CQ8NER5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ACVR1CQ8NER5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ACVR1CQ8NER5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ACVR1CQ8NER5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ACVR1CQ8NER5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ACVR1CQ8NER5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ACVR1CQ8NER5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ACVR1CQ8NER5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ACVR1CQ8NER5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ACVR1CQ8NER5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ACVR1CQ8NER5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ACVR1CQ8NER5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ACVR1CQ8NER5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ACVR1CQ8NER5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ACVR1CQ8NER5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ACVR1CQ8NER5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ACVR1CQ8NER5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ACVR1CQ8NER5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ACVR1CQ8NER5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ACVR1CQ8NER5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ACVR1CQ8NER5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ACVR1CQ8NER5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ACVR1CQ8NER5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ACVR1CQ8NER5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ACVR1CQ8NER5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ACVR1CQ8NER5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ACVR1CQ8NER5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ACVR1CQ8NER5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ACVR1CQ8NER5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ACVR1CQ8NER5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ACVR1CQ8NER5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ACVR1CQ8NER5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ACVR1CQ8NER5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ACVR1CQ8NER5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ACVR1CQ8NER5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ACVR1CQ8NER5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ACVR1CQ8NER5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ACVR1CQ8NER5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ACVR1CQ8NER5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ACVR1CQ8NER5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ACVR1CQ8NER5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ACVR1CQ8NER5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ACVR1CQ8NER5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ACVR1CQ8NER5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ACVR1CQ8NER5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ACVR1CQ8NER5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ACVR1CQ8NER5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ACVR1CQ8NER5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ACVR1CQ8NER5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ACVR1CQ8NER5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ACVR1CQ8NER5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ACVR1CQ8NER5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ACVR1CQ8NER5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ACVR1CQ8NER5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ACVR1CQ8NER5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ACVR1CQ8NER5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ACVR1CQ8NER5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ACVR1CQ8NER5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ACVR1CQ8NER5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ACVR1CQ8NER5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ACVR1CQ8NER5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ACVR1CQ8NER5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ACVR1CQ8NER5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ACVR1CQ8NER5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ACVR1CQ8NER5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ACVR1CQ8NER5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ACVR1CQ8NER5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ACVR1CQ8NER5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ACVR1CQ8NER5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ACVR1CQ8NER5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ACVR1CQ8NER5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ACVR1CQ8NER5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ACVR1CQ8NER5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ACVR1CQ8NER5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ACVR1CQ8NER5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ACVR1CQ8NER5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ACVR1CQ8NER5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ACVR1CQ8NER5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ACVR1CQ8NER5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ACVR1CQ8NER5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ACVR1CQ8NER5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ACVR1CQ8NER5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ACVR1CQ8NER5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ACVR1CQ8NER5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ACVR1CQ8NER5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ACVR1CQ8NER5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ACVR1CQ8NER5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ACVR1CQ8NER5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms