Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND30

PPFIBP2, Liprin-beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP2Q8ND30 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPFIBP2Q8ND30 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPFIBP2Q8ND30 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPFIBP2Q8ND30 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPFIBP2Q8ND30 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PPFIBP2Q8ND30 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPFIBP2Q8ND30 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPFIBP2Q8ND30 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPFIBP2Q8ND30 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PPFIBP2Q8ND30 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
PPFIBP2Q8ND30 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PPFIBP2Q8ND30 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPFIBP2Q8ND30 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPFIBP2Q8ND30 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPFIBP2Q8ND30 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPFIBP2Q8ND30 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPFIBP2Q8ND30 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PPFIBP2Q8ND30 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
PPFIBP2Q8ND30 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPFIBP2Q8ND30 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPFIBP2Q8ND30 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPFIBP2Q8ND30 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPFIBP2Q8ND30 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPFIBP2Q8ND30 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPFIBP2Q8ND30 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPFIBP2Q8ND30 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPFIBP2Q8ND30 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPFIBP2Q8ND30 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPFIBP2Q8ND30 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPFIBP2Q8ND30 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPFIBP2Q8ND30 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PPFIBP2Q8ND30 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPFIBP2Q8ND30 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPFIBP2Q8ND30 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PPFIBP2Q8ND30 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPFIBP2Q8ND30 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPFIBP2Q8ND30 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPFIBP2Q8ND30 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPFIBP2Q8ND30 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPFIBP2Q8ND30 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPFIBP2Q8ND30 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPFIBP2Q8ND30 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPFIBP2Q8ND30 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPFIBP2Q8ND30 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPFIBP2Q8ND30 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPFIBP2Q8ND30 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPFIBP2Q8ND30 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPFIBP2Q8ND30 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPFIBP2Q8ND30 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPFIBP2Q8ND30 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPFIBP2Q8ND30 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPFIBP2Q8ND30 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPFIBP2Q8ND30 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPFIBP2Q8ND30 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PPFIBP2Q8ND30 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPFIBP2Q8ND30 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPFIBP2Q8ND30 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPFIBP2Q8ND30 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPFIBP2Q8ND30 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPFIBP2Q8ND30 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPFIBP2Q8ND30 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPFIBP2Q8ND30 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPFIBP2Q8ND30 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPFIBP2Q8ND30 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPFIBP2Q8ND30 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPFIBP2Q8ND30 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPFIBP2Q8ND30 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPFIBP2Q8ND30 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPFIBP2Q8ND30 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPFIBP2Q8ND30 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPFIBP2Q8ND30 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPFIBP2Q8ND30 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPFIBP2Q8ND30 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PPFIBP2Q8ND30 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPFIBP2Q8ND30 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPFIBP2Q8ND30 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPFIBP2Q8ND30 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPFIBP2Q8ND30 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPFIBP2Q8ND30 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPFIBP2Q8ND30 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPFIBP2Q8ND30 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPFIBP2Q8ND30 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPFIBP2Q8ND30 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPFIBP2Q8ND30 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPFIBP2Q8ND30 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPFIBP2Q8ND30 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPFIBP2Q8ND30 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPFIBP2Q8ND30 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPFIBP2Q8ND30 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPFIBP2Q8ND30 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPFIBP2Q8ND30 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPFIBP2Q8ND30 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PPFIBP2Q8ND30 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PPFIBP2Q8ND30 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPFIBP2Q8ND30 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPFIBP2Q8ND30 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPFIBP2Q8ND30 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPFIBP2Q8ND30 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPFIBP2Q8ND30 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPFIBP2Q8ND30 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms