Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND30

PPFIBP2, Liprin-beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP2Q8ND30 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
PPFIBP2Q8ND30 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PPFIBP2Q8ND30 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PPFIBP2Q8ND30 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PPFIBP2Q8ND30 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
PPFIBP2Q8ND30 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PPFIBP2Q8ND30 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PPFIBP2Q8ND30 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
PPFIBP2Q8ND30 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PPFIBP2Q8ND30 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PPFIBP2Q8ND30 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.69
PPFIBP2Q8ND30 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PPFIBP2Q8ND30 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PPFIBP2Q8ND30 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PPFIBP2Q8ND30 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PPFIBP2Q8ND30 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PPFIBP2Q8ND30 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PPFIBP2Q8ND30 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PPFIBP2Q8ND30 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PPFIBP2Q8ND30 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PPFIBP2Q8ND30 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PPFIBP2Q8ND30 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PPFIBP2Q8ND30 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PPFIBP2Q8ND30 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PPFIBP2Q8ND30 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PPFIBP2Q8ND30 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PPFIBP2Q8ND30 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PPFIBP2Q8ND30 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PPFIBP2Q8ND30 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PPFIBP2Q8ND30 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PPFIBP2Q8ND30 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PPFIBP2Q8ND30 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PPFIBP2Q8ND30 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PPFIBP2Q8ND30 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PPFIBP2Q8ND30 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PPFIBP2Q8ND30 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PPFIBP2Q8ND30 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PPFIBP2Q8ND30 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PPFIBP2Q8ND30 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PPFIBP2Q8ND30 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PPFIBP2Q8ND30 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
PPFIBP2Q8ND30 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PPFIBP2Q8ND30 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PPFIBP2Q8ND30 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PPFIBP2Q8ND30 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PPFIBP2Q8ND30 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PPFIBP2Q8ND30 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PPFIBP2Q8ND30 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PPFIBP2Q8ND30 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PPFIBP2Q8ND30 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PPFIBP2Q8ND30 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PPFIBP2Q8ND30 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PPFIBP2Q8ND30 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PPFIBP2Q8ND30 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PPFIBP2Q8ND30 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PPFIBP2Q8ND30 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PPFIBP2Q8ND30 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PPFIBP2Q8ND30 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PPFIBP2Q8ND30 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PPFIBP2Q8ND30 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PPFIBP2Q8ND30 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PPFIBP2Q8ND30 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PPFIBP2Q8ND30 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PPFIBP2Q8ND30 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PPFIBP2Q8ND30 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPFIBP2Q8ND30 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPFIBP2Q8ND30 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PPFIBP2Q8ND30 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PPFIBP2Q8ND30 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PPFIBP2Q8ND30 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPFIBP2Q8ND30 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPFIBP2Q8ND30 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPFIBP2Q8ND30 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPFIBP2Q8ND30 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPFIBP2Q8ND30 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPFIBP2Q8ND30 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PPFIBP2Q8ND30 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPFIBP2Q8ND30 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPFIBP2Q8ND30 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PPFIBP2Q8ND30 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPFIBP2Q8ND30 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPFIBP2Q8ND30 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPFIBP2Q8ND30 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPFIBP2Q8ND30 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPFIBP2Q8ND30 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPFIBP2Q8ND30 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPFIBP2Q8ND30 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPFIBP2Q8ND30 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPFIBP2Q8ND30 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PPFIBP2Q8ND30 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PPFIBP2Q8ND30 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PPFIBP2Q8ND30 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PPFIBP2Q8ND30 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PPFIBP2Q8ND30 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPFIBP2Q8ND30 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPFIBP2Q8ND30 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPFIBP2Q8ND30 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPFIBP2Q8ND30 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPFIBP2Q8ND30 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPFIBP2Q8ND30 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms