Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CARMIL3Q8ND23 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CARMIL3Q8ND23 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
CARMIL3Q8ND23 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
CARMIL3Q8ND23 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CARMIL3Q8ND23 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CARMIL3Q8ND23 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CARMIL3Q8ND23 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CARMIL3Q8ND23 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CARMIL3Q8ND23 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CARMIL3Q8ND23 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CARMIL3Q8ND23 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CARMIL3Q8ND23 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CARMIL3Q8ND23 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
CARMIL3Q8ND23 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CARMIL3Q8ND23 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CARMIL3Q8ND23 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CARMIL3Q8ND23 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CARMIL3Q8ND23 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CARMIL3Q8ND23 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CARMIL3Q8ND23 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CARMIL3Q8ND23 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CARMIL3Q8ND23 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CARMIL3Q8ND23 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CARMIL3Q8ND23 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CARMIL3Q8ND23 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CARMIL3Q8ND23 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CARMIL3Q8ND23 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CARMIL3Q8ND23 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CARMIL3Q8ND23 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CARMIL3Q8ND23 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CARMIL3Q8ND23 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
CARMIL3Q8ND23 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CARMIL3Q8ND23 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
CARMIL3Q8ND23 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CARMIL3Q8ND23 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CARMIL3Q8ND23 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CARMIL3Q8ND23 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CARMIL3Q8ND23 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CARMIL3Q8ND23 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CARMIL3Q8ND23 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
CARMIL3Q8ND23 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CARMIL3Q8ND23 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CARMIL3Q8ND23 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CARMIL3Q8ND23 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
CARMIL3Q8ND23 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
CARMIL3Q8ND23 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CARMIL3Q8ND23 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CARMIL3Q8ND23 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.22
CARMIL3Q8ND23 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CARMIL3Q8ND23 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
CARMIL3Q8ND23 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CARMIL3Q8ND23 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CARMIL3Q8ND23 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CARMIL3Q8ND23 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CARMIL3Q8ND23 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CARMIL3Q8ND23 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CARMIL3Q8ND23 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CARMIL3Q8ND23 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CARMIL3Q8ND23 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CARMIL3Q8ND23 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CARMIL3Q8ND23 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CARMIL3Q8ND23 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CARMIL3Q8ND23 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CARMIL3Q8ND23 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
CARMIL3Q8ND23 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CARMIL3Q8ND23 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CARMIL3Q8ND23 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
CARMIL3Q8ND23 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
CARMIL3Q8ND23 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
CARMIL3Q8ND23 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CARMIL3Q8ND23 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CARMIL3Q8ND23 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC35■■■■□ 3.19
CARMIL3Q8ND23 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CARMIL3Q8ND23 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CARMIL3Q8ND23 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
CARMIL3Q8ND23 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CARMIL3Q8ND23 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CARMIL3Q8ND23 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CARMIL3Q8ND23 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CARMIL3Q8ND23 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CARMIL3Q8ND23 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CARMIL3Q8ND23 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CARMIL3Q8ND23 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CARMIL3Q8ND23 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CARMIL3Q8ND23 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CARMIL3Q8ND23 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CARMIL3Q8ND23 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CARMIL3Q8ND23 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CARMIL3Q8ND23 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CARMIL3Q8ND23 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CARMIL3Q8ND23 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
CARMIL3Q8ND23 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CARMIL3Q8ND23 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CARMIL3Q8ND23 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CARMIL3Q8ND23 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CARMIL3Q8ND23 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CARMIL3Q8ND23 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CARMIL3Q8ND23 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CARMIL3Q8ND23 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms