Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAT1

POMGNT2, Protein O-linked-mannose beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMGNT2Q8NAT1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POMGNT2Q8NAT1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POMGNT2Q8NAT1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POMGNT2Q8NAT1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POMGNT2Q8NAT1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POMGNT2Q8NAT1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POMGNT2Q8NAT1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POMGNT2Q8NAT1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POMGNT2Q8NAT1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POMGNT2Q8NAT1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POMGNT2Q8NAT1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POMGNT2Q8NAT1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POMGNT2Q8NAT1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POMGNT2Q8NAT1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POMGNT2Q8NAT1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POMGNT2Q8NAT1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
POMGNT2Q8NAT1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POMGNT2Q8NAT1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POMGNT2Q8NAT1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POMGNT2Q8NAT1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
POMGNT2Q8NAT1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POMGNT2Q8NAT1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POMGNT2Q8NAT1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POMGNT2Q8NAT1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POMGNT2Q8NAT1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POMGNT2Q8NAT1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POMGNT2Q8NAT1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POMGNT2Q8NAT1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POMGNT2Q8NAT1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POMGNT2Q8NAT1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POMGNT2Q8NAT1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POMGNT2Q8NAT1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POMGNT2Q8NAT1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POMGNT2Q8NAT1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POMGNT2Q8NAT1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POMGNT2Q8NAT1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POMGNT2Q8NAT1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POMGNT2Q8NAT1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POMGNT2Q8NAT1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POMGNT2Q8NAT1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POMGNT2Q8NAT1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POMGNT2Q8NAT1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POMGNT2Q8NAT1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POMGNT2Q8NAT1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POMGNT2Q8NAT1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POMGNT2Q8NAT1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
POMGNT2Q8NAT1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POMGNT2Q8NAT1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POMGNT2Q8NAT1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POMGNT2Q8NAT1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POMGNT2Q8NAT1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POMGNT2Q8NAT1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POMGNT2Q8NAT1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
POMGNT2Q8NAT1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POMGNT2Q8NAT1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POMGNT2Q8NAT1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POMGNT2Q8NAT1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POMGNT2Q8NAT1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POMGNT2Q8NAT1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POMGNT2Q8NAT1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POMGNT2Q8NAT1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POMGNT2Q8NAT1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POMGNT2Q8NAT1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POMGNT2Q8NAT1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POMGNT2Q8NAT1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POMGNT2Q8NAT1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
POMGNT2Q8NAT1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POMGNT2Q8NAT1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POMGNT2Q8NAT1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POMGNT2Q8NAT1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POMGNT2Q8NAT1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POMGNT2Q8NAT1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POMGNT2Q8NAT1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POMGNT2Q8NAT1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POMGNT2Q8NAT1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POMGNT2Q8NAT1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POMGNT2Q8NAT1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POMGNT2Q8NAT1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POMGNT2Q8NAT1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POMGNT2Q8NAT1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POMGNT2Q8NAT1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POMGNT2Q8NAT1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POMGNT2Q8NAT1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POMGNT2Q8NAT1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POMGNT2Q8NAT1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POMGNT2Q8NAT1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POMGNT2Q8NAT1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POMGNT2Q8NAT1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POMGNT2Q8NAT1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POMGNT2Q8NAT1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POMGNT2Q8NAT1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POMGNT2Q8NAT1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POMGNT2Q8NAT1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POMGNT2Q8NAT1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POMGNT2Q8NAT1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POMGNT2Q8NAT1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POMGNT2Q8NAT1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POMGNT2Q8NAT1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POMGNT2Q8NAT1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POMGNT2Q8NAT1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms