Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC29Q8NA56 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC29Q8NA56 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC29Q8NA56 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC29Q8NA56 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC29Q8NA56 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC29Q8NA56 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC29Q8NA56 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTC29Q8NA56 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTC29Q8NA56 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTC29Q8NA56 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTC29Q8NA56 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTC29Q8NA56 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTC29Q8NA56 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTC29Q8NA56 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTC29Q8NA56 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTC29Q8NA56 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTC29Q8NA56 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTC29Q8NA56 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TTC29Q8NA56 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TTC29Q8NA56 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTC29Q8NA56 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTC29Q8NA56 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TTC29Q8NA56 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTC29Q8NA56 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTC29Q8NA56 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TTC29Q8NA56 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTC29Q8NA56 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTC29Q8NA56 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTC29Q8NA56 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTC29Q8NA56 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTC29Q8NA56 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTC29Q8NA56 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTC29Q8NA56 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTC29Q8NA56 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTC29Q8NA56 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTC29Q8NA56 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTC29Q8NA56 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTC29Q8NA56 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTC29Q8NA56 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTC29Q8NA56 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTC29Q8NA56 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TTC29Q8NA56 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TTC29Q8NA56 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTC29Q8NA56 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TTC29Q8NA56 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TTC29Q8NA56 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TTC29Q8NA56 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TTC29Q8NA56 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTC29Q8NA56 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTC29Q8NA56 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTC29Q8NA56 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTC29Q8NA56 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTC29Q8NA56 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTC29Q8NA56 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTC29Q8NA56 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTC29Q8NA56 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTC29Q8NA56 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTC29Q8NA56 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TTC29Q8NA56 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTC29Q8NA56 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTC29Q8NA56 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTC29Q8NA56 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTC29Q8NA56 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTC29Q8NA56 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTC29Q8NA56 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTC29Q8NA56 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TTC29Q8NA56 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTC29Q8NA56 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTC29Q8NA56 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTC29Q8NA56 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTC29Q8NA56 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTC29Q8NA56 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TTC29Q8NA56 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TTC29Q8NA56 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TTC29Q8NA56 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TTC29Q8NA56 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TTC29Q8NA56 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TTC29Q8NA56 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TTC29Q8NA56 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTC29Q8NA56 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTC29Q8NA56 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTC29Q8NA56 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TTC29Q8NA56 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TTC29Q8NA56 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTC29Q8NA56 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTC29Q8NA56 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTC29Q8NA56 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTC29Q8NA56 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTC29Q8NA56 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTC29Q8NA56 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TTC29Q8NA56 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TTC29Q8NA56 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TTC29Q8NA56 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TTC29Q8NA56 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTC29Q8NA56 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTC29Q8NA56 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TTC29Q8NA56 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTC29Q8NA56 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTC29Q8NA56 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms