Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C6

NIN, Ninein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINQ8N4C6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NINQ8N4C6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NINQ8N4C6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NINQ8N4C6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NINQ8N4C6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NINQ8N4C6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NINQ8N4C6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NINQ8N4C6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NINQ8N4C6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NINQ8N4C6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NINQ8N4C6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NINQ8N4C6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NINQ8N4C6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NINQ8N4C6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NINQ8N4C6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NINQ8N4C6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NINQ8N4C6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NINQ8N4C6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NINQ8N4C6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NINQ8N4C6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NINQ8N4C6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NINQ8N4C6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NINQ8N4C6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NINQ8N4C6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NINQ8N4C6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NINQ8N4C6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NINQ8N4C6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NINQ8N4C6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NINQ8N4C6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NINQ8N4C6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NINQ8N4C6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NINQ8N4C6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NINQ8N4C6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NINQ8N4C6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NINQ8N4C6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NINQ8N4C6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NINQ8N4C6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NINQ8N4C6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NINQ8N4C6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NINQ8N4C6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NINQ8N4C6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NINQ8N4C6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NINQ8N4C6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NINQ8N4C6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NINQ8N4C6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NINQ8N4C6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NINQ8N4C6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NINQ8N4C6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NINQ8N4C6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NINQ8N4C6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NINQ8N4C6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NINQ8N4C6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NINQ8N4C6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NINQ8N4C6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NINQ8N4C6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NINQ8N4C6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NINQ8N4C6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NINQ8N4C6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NINQ8N4C6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NINQ8N4C6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NINQ8N4C6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NINQ8N4C6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NINQ8N4C6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NINQ8N4C6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NINQ8N4C6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NINQ8N4C6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NINQ8N4C6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NINQ8N4C6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NINQ8N4C6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NINQ8N4C6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NINQ8N4C6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NINQ8N4C6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NINQ8N4C6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NINQ8N4C6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NINQ8N4C6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
NINQ8N4C6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NINQ8N4C6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NINQ8N4C6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NINQ8N4C6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NINQ8N4C6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NINQ8N4C6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NINQ8N4C6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NINQ8N4C6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NINQ8N4C6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NINQ8N4C6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NINQ8N4C6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NINQ8N4C6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NINQ8N4C6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NINQ8N4C6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NINQ8N4C6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NINQ8N4C6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NINQ8N4C6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NINQ8N4C6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NINQ8N4C6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NINQ8N4C6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NINQ8N4C6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NINQ8N4C6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NINQ8N4C6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NINQ8N4C6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NINQ8N4C6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
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