Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
PROM2Q8N271 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
PROM2Q8N271 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PROM2Q8N271 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
PROM2Q8N271 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
PROM2Q8N271 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
PROM2Q8N271 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
PROM2Q8N271 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
PROM2Q8N271 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.5
PROM2Q8N271 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
PROM2Q8N271 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
PROM2Q8N271 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
PROM2Q8N271 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
PROM2Q8N271 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PROM2Q8N271 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
PROM2Q8N271 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PROM2Q8N271 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PROM2Q8N271 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
PROM2Q8N271 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
PROM2Q8N271 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PROM2Q8N271 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PROM2Q8N271 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
PROM2Q8N271 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
PROM2Q8N271 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
PROM2Q8N271 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
PROM2Q8N271 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
PROM2Q8N271 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PROM2Q8N271 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PROM2Q8N271 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PROM2Q8N271 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PROM2Q8N271 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
PROM2Q8N271 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
PROM2Q8N271 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
PROM2Q8N271 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
PROM2Q8N271 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PROM2Q8N271 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
PROM2Q8N271 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
PROM2Q8N271 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PROM2Q8N271 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PROM2Q8N271 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
PROM2Q8N271 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PROM2Q8N271 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
PROM2Q8N271 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PROM2Q8N271 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
PROM2Q8N271 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
PROM2Q8N271 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
PROM2Q8N271 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PROM2Q8N271 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
PROM2Q8N271 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
PROM2Q8N271 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
PROM2Q8N271 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PROM2Q8N271 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PROM2Q8N271 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PROM2Q8N271 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PROM2Q8N271 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
PROM2Q8N271 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PROM2Q8N271 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PROM2Q8N271 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PROM2Q8N271 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PROM2Q8N271 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PROM2Q8N271 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PROM2Q8N271 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PROM2Q8N271 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
PROM2Q8N271 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.32■■■■□ 3.4
PROM2Q8N271 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PROM2Q8N271 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PROM2Q8N271 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PROM2Q8N271 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PROM2Q8N271 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PROM2Q8N271 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
PROM2Q8N271 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PROM2Q8N271 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PROM2Q8N271 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PROM2Q8N271 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PROM2Q8N271 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
PROM2Q8N271 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PROM2Q8N271 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PROM2Q8N271 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
PROM2Q8N271 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PROM2Q8N271 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PROM2Q8N271 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PROM2Q8N271 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PROM2Q8N271 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PROM2Q8N271 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
PROM2Q8N271 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PROM2Q8N271 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PROM2Q8N271 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PROM2Q8N271 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PROM2Q8N271 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PROM2Q8N271 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PROM2Q8N271 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
PROM2Q8N271 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC36.04■■■■□ 3.36
PROM2Q8N271 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PROM2Q8N271 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PROM2Q8N271 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
PROM2Q8N271 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PROM2Q8N271 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PROM2Q8N271 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PROM2Q8N271 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PROM2Q8N271 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms