Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU2

WDR17, WD repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR17Q8IZU2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
WDR17Q8IZU2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
WDR17Q8IZU2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
WDR17Q8IZU2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
WDR17Q8IZU2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC37.8■■■■□ 3.64
WDR17Q8IZU2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
WDR17Q8IZU2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
WDR17Q8IZU2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
WDR17Q8IZU2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
WDR17Q8IZU2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
WDR17Q8IZU2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
WDR17Q8IZU2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
WDR17Q8IZU2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
WDR17Q8IZU2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
WDR17Q8IZU2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC37.62■■■■□ 3.61
WDR17Q8IZU2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
WDR17Q8IZU2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
WDR17Q8IZU2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
WDR17Q8IZU2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
WDR17Q8IZU2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
WDR17Q8IZU2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
WDR17Q8IZU2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
WDR17Q8IZU2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
WDR17Q8IZU2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
WDR17Q8IZU2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
WDR17Q8IZU2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
WDR17Q8IZU2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.59
WDR17Q8IZU2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
WDR17Q8IZU2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
WDR17Q8IZU2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
WDR17Q8IZU2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC37.45■■■■□ 3.58
WDR17Q8IZU2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
WDR17Q8IZU2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
WDR17Q8IZU2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
WDR17Q8IZU2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
WDR17Q8IZU2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
WDR17Q8IZU2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
WDR17Q8IZU2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
WDR17Q8IZU2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
WDR17Q8IZU2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
WDR17Q8IZU2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
WDR17Q8IZU2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
WDR17Q8IZU2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
WDR17Q8IZU2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
WDR17Q8IZU2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
WDR17Q8IZU2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
WDR17Q8IZU2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
WDR17Q8IZU2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
WDR17Q8IZU2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
WDR17Q8IZU2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
WDR17Q8IZU2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
WDR17Q8IZU2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
WDR17Q8IZU2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
WDR17Q8IZU2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
WDR17Q8IZU2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
WDR17Q8IZU2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
WDR17Q8IZU2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
WDR17Q8IZU2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
WDR17Q8IZU2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
WDR17Q8IZU2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
WDR17Q8IZU2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
WDR17Q8IZU2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
WDR17Q8IZU2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
WDR17Q8IZU2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
WDR17Q8IZU2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
WDR17Q8IZU2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
WDR17Q8IZU2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
WDR17Q8IZU2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
WDR17Q8IZU2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
WDR17Q8IZU2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
WDR17Q8IZU2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
WDR17Q8IZU2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
WDR17Q8IZU2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
WDR17Q8IZU2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
WDR17Q8IZU2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
WDR17Q8IZU2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
WDR17Q8IZU2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
WDR17Q8IZU2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
WDR17Q8IZU2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
WDR17Q8IZU2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
WDR17Q8IZU2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
WDR17Q8IZU2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
WDR17Q8IZU2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
WDR17Q8IZU2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
WDR17Q8IZU2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
WDR17Q8IZU2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.99■■■■□ 3.51
WDR17Q8IZU2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
WDR17Q8IZU2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
WDR17Q8IZU2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
WDR17Q8IZU2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
WDR17Q8IZU2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
WDR17Q8IZU2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
WDR17Q8IZU2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
WDR17Q8IZU2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
WDR17Q8IZU2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
WDR17Q8IZU2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
WDR17Q8IZU2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
WDR17Q8IZU2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
WDR17Q8IZU2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
WDR17Q8IZU2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms