Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYS1

PM20D2, Peptidase M20 domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PM20D2Q8IYS1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PM20D2Q8IYS1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PM20D2Q8IYS1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PM20D2Q8IYS1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PM20D2Q8IYS1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PM20D2Q8IYS1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PM20D2Q8IYS1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PM20D2Q8IYS1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PM20D2Q8IYS1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PM20D2Q8IYS1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PM20D2Q8IYS1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PM20D2Q8IYS1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PM20D2Q8IYS1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PM20D2Q8IYS1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PM20D2Q8IYS1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PM20D2Q8IYS1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PM20D2Q8IYS1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PM20D2Q8IYS1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PM20D2Q8IYS1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PM20D2Q8IYS1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PM20D2Q8IYS1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PM20D2Q8IYS1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PM20D2Q8IYS1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PM20D2Q8IYS1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PM20D2Q8IYS1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PM20D2Q8IYS1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PM20D2Q8IYS1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PM20D2Q8IYS1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PM20D2Q8IYS1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PM20D2Q8IYS1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PM20D2Q8IYS1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PM20D2Q8IYS1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PM20D2Q8IYS1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PM20D2Q8IYS1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PM20D2Q8IYS1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PM20D2Q8IYS1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PM20D2Q8IYS1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PM20D2Q8IYS1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PM20D2Q8IYS1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PM20D2Q8IYS1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PM20D2Q8IYS1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PM20D2Q8IYS1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PM20D2Q8IYS1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PM20D2Q8IYS1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PM20D2Q8IYS1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PM20D2Q8IYS1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PM20D2Q8IYS1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PM20D2Q8IYS1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PM20D2Q8IYS1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PM20D2Q8IYS1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PM20D2Q8IYS1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PM20D2Q8IYS1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PM20D2Q8IYS1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PM20D2Q8IYS1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PM20D2Q8IYS1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PM20D2Q8IYS1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PM20D2Q8IYS1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PM20D2Q8IYS1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PM20D2Q8IYS1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PM20D2Q8IYS1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PM20D2Q8IYS1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PM20D2Q8IYS1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PM20D2Q8IYS1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PM20D2Q8IYS1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PM20D2Q8IYS1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PM20D2Q8IYS1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PM20D2Q8IYS1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PM20D2Q8IYS1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PM20D2Q8IYS1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PM20D2Q8IYS1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PM20D2Q8IYS1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PM20D2Q8IYS1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PM20D2Q8IYS1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PM20D2Q8IYS1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PM20D2Q8IYS1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PM20D2Q8IYS1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PM20D2Q8IYS1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PM20D2Q8IYS1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PM20D2Q8IYS1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PM20D2Q8IYS1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PM20D2Q8IYS1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PM20D2Q8IYS1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PM20D2Q8IYS1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PM20D2Q8IYS1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PM20D2Q8IYS1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PM20D2Q8IYS1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PM20D2Q8IYS1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PM20D2Q8IYS1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PM20D2Q8IYS1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PM20D2Q8IYS1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PM20D2Q8IYS1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PM20D2Q8IYS1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PM20D2Q8IYS1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PM20D2Q8IYS1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PM20D2Q8IYS1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PM20D2Q8IYS1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PM20D2Q8IYS1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PM20D2Q8IYS1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PM20D2Q8IYS1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PM20D2Q8IYS1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms