Protein–RNA interactions for Protein: Q86YV5

PRAG1, Tyrosine-protein kinase PRAG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAG1Q86YV5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
PRAG1Q86YV5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
PRAG1Q86YV5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
PRAG1Q86YV5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
PRAG1Q86YV5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
PRAG1Q86YV5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
PRAG1Q86YV5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
PRAG1Q86YV5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
PRAG1Q86YV5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC40.26■■■■■ 4.04
PRAG1Q86YV5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
PRAG1Q86YV5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
PRAG1Q86YV5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
PRAG1Q86YV5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.02
PRAG1Q86YV5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
PRAG1Q86YV5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
PRAG1Q86YV5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
PRAG1Q86YV5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.17■■■■■ 4.02
PRAG1Q86YV5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
PRAG1Q86YV5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
PRAG1Q86YV5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
PRAG1Q86YV5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
PRAG1Q86YV5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
PRAG1Q86YV5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
PRAG1Q86YV5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
PRAG1Q86YV5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
PRAG1Q86YV5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
PRAG1Q86YV5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
PRAG1Q86YV5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC40.05■■■■■ 4
PRAG1Q86YV5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC40.05■■■■■ 4
PRAG1Q86YV5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
PRAG1Q86YV5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
PRAG1Q86YV5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
PRAG1Q86YV5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
PRAG1Q86YV5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
PRAG1Q86YV5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
PRAG1Q86YV5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
PRAG1Q86YV5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
PRAG1Q86YV5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
PRAG1Q86YV5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
PRAG1Q86YV5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
PRAG1Q86YV5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
PRAG1Q86YV5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC39.9■■■■□ 3.98
PRAG1Q86YV5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC39.87■■■■□ 3.97
PRAG1Q86YV5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
PRAG1Q86YV5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
PRAG1Q86YV5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
PRAG1Q86YV5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
PRAG1Q86YV5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
PRAG1Q86YV5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
PRAG1Q86YV5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
PRAG1Q86YV5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
PRAG1Q86YV5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC39.75■■■■□ 3.95
PRAG1Q86YV5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
PRAG1Q86YV5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
PRAG1Q86YV5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
PRAG1Q86YV5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
PRAG1Q86YV5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
PRAG1Q86YV5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
PRAG1Q86YV5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.66■■■■□ 3.94
PRAG1Q86YV5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC39.64■■■■□ 3.94
PRAG1Q86YV5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
PRAG1Q86YV5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
PRAG1Q86YV5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
PRAG1Q86YV5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.92
PRAG1Q86YV5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.57■■■■□ 3.92
PRAG1Q86YV5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.92
PRAG1Q86YV5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC39.56■■■■□ 3.92
PRAG1Q86YV5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
PRAG1Q86YV5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
PRAG1Q86YV5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
PRAG1Q86YV5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
PRAG1Q86YV5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
PRAG1Q86YV5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
PRAG1Q86YV5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC39.51■■■■□ 3.92
PRAG1Q86YV5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
PRAG1Q86YV5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
PRAG1Q86YV5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC39.49■■■■□ 3.91
PRAG1Q86YV5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC39.48■■■■□ 3.91
PRAG1Q86YV5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
PRAG1Q86YV5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
PRAG1Q86YV5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC39.47■■■■□ 3.91
PRAG1Q86YV5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
PRAG1Q86YV5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC39.46■■■■□ 3.91
PRAG1Q86YV5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
PRAG1Q86YV5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
PRAG1Q86YV5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
PRAG1Q86YV5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
PRAG1Q86YV5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
PRAG1Q86YV5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
PRAG1Q86YV5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
PRAG1Q86YV5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
PRAG1Q86YV5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
PRAG1Q86YV5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
PRAG1Q86YV5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
PRAG1Q86YV5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
PRAG1Q86YV5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
PRAG1Q86YV5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
PRAG1Q86YV5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
PRAG1Q86YV5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
PRAG1Q86YV5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC39.3■■■■□ 3.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms