Protein–RNA interactions for Protein: Q86X29

LSR, Lipolysis-stimulated lipoprotein receptor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSRQ86X29 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LSRQ86X29 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LSRQ86X29 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LSRQ86X29 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LSRQ86X29 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LSRQ86X29 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LSRQ86X29 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LSRQ86X29 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LSRQ86X29 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LSRQ86X29 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LSRQ86X29 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LSRQ86X29 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LSRQ86X29 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LSRQ86X29 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LSRQ86X29 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LSRQ86X29 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LSRQ86X29 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LSRQ86X29 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LSRQ86X29 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LSRQ86X29 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LSRQ86X29 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LSRQ86X29 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LSRQ86X29 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LSRQ86X29 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LSRQ86X29 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LSRQ86X29 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LSRQ86X29 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LSRQ86X29 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LSRQ86X29 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LSRQ86X29 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LSRQ86X29 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LSRQ86X29 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LSRQ86X29 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LSRQ86X29 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LSRQ86X29 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LSRQ86X29 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LSRQ86X29 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LSRQ86X29 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LSRQ86X29 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LSRQ86X29 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LSRQ86X29 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LSRQ86X29 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LSRQ86X29 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LSRQ86X29 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LSRQ86X29 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LSRQ86X29 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LSRQ86X29 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LSRQ86X29 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LSRQ86X29 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LSRQ86X29 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LSRQ86X29 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LSRQ86X29 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LSRQ86X29 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LSRQ86X29 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LSRQ86X29 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LSRQ86X29 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LSRQ86X29 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LSRQ86X29 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LSRQ86X29 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LSRQ86X29 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LSRQ86X29 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LSRQ86X29 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
LSRQ86X29 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LSRQ86X29 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LSRQ86X29 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LSRQ86X29 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LSRQ86X29 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LSRQ86X29 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LSRQ86X29 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LSRQ86X29 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LSRQ86X29 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LSRQ86X29 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LSRQ86X29 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LSRQ86X29 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LSRQ86X29 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LSRQ86X29 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LSRQ86X29 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LSRQ86X29 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LSRQ86X29 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LSRQ86X29 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LSRQ86X29 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LSRQ86X29 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LSRQ86X29 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LSRQ86X29 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LSRQ86X29 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LSRQ86X29 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LSRQ86X29 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LSRQ86X29 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LSRQ86X29 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LSRQ86X29 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LSRQ86X29 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LSRQ86X29 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LSRQ86X29 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LSRQ86X29 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LSRQ86X29 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LSRQ86X29 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LSRQ86X29 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LSRQ86X29 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LSRQ86X29 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LSRQ86X29 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms