Protein–RNA interactions for Protein: Q86US8

SMG6, Telomerase-binding protein EST1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG6Q86US8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
SMG6Q86US8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
SMG6Q86US8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
SMG6Q86US8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
SMG6Q86US8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
SMG6Q86US8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
SMG6Q86US8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
SMG6Q86US8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC38.07■■■■□ 3.68
SMG6Q86US8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
SMG6Q86US8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
SMG6Q86US8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
SMG6Q86US8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
SMG6Q86US8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
SMG6Q86US8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
SMG6Q86US8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
SMG6Q86US8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
SMG6Q86US8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
SMG6Q86US8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
SMG6Q86US8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
SMG6Q86US8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
SMG6Q86US8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
SMG6Q86US8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
SMG6Q86US8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
SMG6Q86US8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
SMG6Q86US8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
SMG6Q86US8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
SMG6Q86US8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
SMG6Q86US8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
SMG6Q86US8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
SMG6Q86US8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
SMG6Q86US8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
SMG6Q86US8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
SMG6Q86US8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
SMG6Q86US8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
SMG6Q86US8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
SMG6Q86US8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
SMG6Q86US8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
SMG6Q86US8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
SMG6Q86US8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
SMG6Q86US8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
SMG6Q86US8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
SMG6Q86US8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
SMG6Q86US8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
SMG6Q86US8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
SMG6Q86US8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
SMG6Q86US8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
SMG6Q86US8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
SMG6Q86US8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
SMG6Q86US8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
SMG6Q86US8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
SMG6Q86US8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
SMG6Q86US8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
SMG6Q86US8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
SMG6Q86US8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
SMG6Q86US8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
SMG6Q86US8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
SMG6Q86US8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
SMG6Q86US8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
SMG6Q86US8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.61
SMG6Q86US8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
SMG6Q86US8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
SMG6Q86US8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
SMG6Q86US8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
SMG6Q86US8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
SMG6Q86US8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
SMG6Q86US8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
SMG6Q86US8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
SMG6Q86US8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
SMG6Q86US8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
SMG6Q86US8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
SMG6Q86US8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
SMG6Q86US8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
SMG6Q86US8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
SMG6Q86US8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
SMG6Q86US8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
SMG6Q86US8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
SMG6Q86US8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
SMG6Q86US8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
SMG6Q86US8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
SMG6Q86US8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
SMG6Q86US8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
SMG6Q86US8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
SMG6Q86US8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
SMG6Q86US8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
SMG6Q86US8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
SMG6Q86US8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
SMG6Q86US8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
SMG6Q86US8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
SMG6Q86US8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
SMG6Q86US8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
SMG6Q86US8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
SMG6Q86US8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
SMG6Q86US8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
SMG6Q86US8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
SMG6Q86US8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
SMG6Q86US8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
SMG6Q86US8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
SMG6Q86US8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
SMG6Q86US8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
SMG6Q86US8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms