Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
UBE2Q1Q7Z7E8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
UBE2Q1Q7Z7E8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
UBE2Q1Q7Z7E8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
UBE2Q1Q7Z7E8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
UBE2Q1Q7Z7E8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
UBE2Q1Q7Z7E8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
UBE2Q1Q7Z7E8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
UBE2Q1Q7Z7E8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
UBE2Q1Q7Z7E8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
UBE2Q1Q7Z7E8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
UBE2Q1Q7Z7E8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
UBE2Q1Q7Z7E8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
UBE2Q1Q7Z7E8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
UBE2Q1Q7Z7E8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
UBE2Q1Q7Z7E8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
UBE2Q1Q7Z7E8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
UBE2Q1Q7Z7E8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
UBE2Q1Q7Z7E8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
UBE2Q1Q7Z7E8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
UBE2Q1Q7Z7E8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
UBE2Q1Q7Z7E8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
UBE2Q1Q7Z7E8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
UBE2Q1Q7Z7E8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
UBE2Q1Q7Z7E8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
UBE2Q1Q7Z7E8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
UBE2Q1Q7Z7E8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
UBE2Q1Q7Z7E8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
UBE2Q1Q7Z7E8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
UBE2Q1Q7Z7E8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
UBE2Q1Q7Z7E8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
UBE2Q1Q7Z7E8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
UBE2Q1Q7Z7E8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
UBE2Q1Q7Z7E8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
UBE2Q1Q7Z7E8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
UBE2Q1Q7Z7E8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
UBE2Q1Q7Z7E8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
UBE2Q1Q7Z7E8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
UBE2Q1Q7Z7E8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
UBE2Q1Q7Z7E8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
UBE2Q1Q7Z7E8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
UBE2Q1Q7Z7E8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
UBE2Q1Q7Z7E8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.48■■■□□ 2.63
UBE2Q1Q7Z7E8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
UBE2Q1Q7Z7E8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
UBE2Q1Q7Z7E8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
UBE2Q1Q7Z7E8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
UBE2Q1Q7Z7E8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
UBE2Q1Q7Z7E8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
UBE2Q1Q7Z7E8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
UBE2Q1Q7Z7E8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
UBE2Q1Q7Z7E8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
UBE2Q1Q7Z7E8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
UBE2Q1Q7Z7E8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
UBE2Q1Q7Z7E8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
UBE2Q1Q7Z7E8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
UBE2Q1Q7Z7E8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
UBE2Q1Q7Z7E8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
UBE2Q1Q7Z7E8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC31.39■■■□□ 2.62
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UBE2Q1Q7Z7E8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
UBE2Q1Q7Z7E8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
UBE2Q1Q7Z7E8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
UBE2Q1Q7Z7E8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
UBE2Q1Q7Z7E8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
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UBE2Q1Q7Z7E8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
UBE2Q1Q7Z7E8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
UBE2Q1Q7Z7E8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
UBE2Q1Q7Z7E8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
UBE2Q1Q7Z7E8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
UBE2Q1Q7Z7E8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
UBE2Q1Q7Z7E8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
UBE2Q1Q7Z7E8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
UBE2Q1Q7Z7E8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
UBE2Q1Q7Z7E8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
UBE2Q1Q7Z7E8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
UBE2Q1Q7Z7E8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
UBE2Q1Q7Z7E8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
UBE2Q1Q7Z7E8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
UBE2Q1Q7Z7E8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
UBE2Q1Q7Z7E8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
UBE2Q1Q7Z7E8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
UBE2Q1Q7Z7E8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
UBE2Q1Q7Z7E8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
UBE2Q1Q7Z7E8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
UBE2Q1Q7Z7E8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.09■■■□□ 2.57
UBE2Q1Q7Z7E8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
UBE2Q1Q7Z7E8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
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