Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z478

DHX29, ATP-dependent RNA helicase DHX29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX29Q7Z478 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
DHX29Q7Z478 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC42.47■■■■■ 4.39
DHX29Q7Z478 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC42.4■■■■■ 4.38
DHX29Q7Z478 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
DHX29Q7Z478 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
DHX29Q7Z478 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
DHX29Q7Z478 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC42.31■■■■■ 4.36
DHX29Q7Z478 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
DHX29Q7Z478 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC42.31■■■■■ 4.36
DHX29Q7Z478 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
DHX29Q7Z478 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC42.28■■■■■ 4.36
DHX29Q7Z478 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC42.28■■■■■ 4.36
DHX29Q7Z478 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
DHX29Q7Z478 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
DHX29Q7Z478 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
DHX29Q7Z478 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
DHX29Q7Z478 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
DHX29Q7Z478 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
DHX29Q7Z478 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
DHX29Q7Z478 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC42.13■■■■■ 4.33
DHX29Q7Z478 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
DHX29Q7Z478 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42.08■■■■■ 4.33
DHX29Q7Z478 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
DHX29Q7Z478 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC42.06■■■■■ 4.32
DHX29Q7Z478 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC42.04■■■■■ 4.32
DHX29Q7Z478 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.04■■■■■ 4.32
DHX29Q7Z478 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.01■■■■■ 4.31
DHX29Q7Z478 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC42.01■■■■■ 4.31
DHX29Q7Z478 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC41.96■■■■■ 4.31
DHX29Q7Z478 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
DHX29Q7Z478 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
DHX29Q7Z478 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC41.95■■■■■ 4.31
DHX29Q7Z478 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.95■■■■■ 4.31
DHX29Q7Z478 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
DHX29Q7Z478 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC41.93■■■■■ 4.3
DHX29Q7Z478 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC41.92■■■■■ 4.3
DHX29Q7Z478 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
DHX29Q7Z478 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
DHX29Q7Z478 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC41.89■■■■■ 4.3
DHX29Q7Z478 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
DHX29Q7Z478 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
DHX29Q7Z478 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC41.85■■■■■ 4.29
DHX29Q7Z478 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
DHX29Q7Z478 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
DHX29Q7Z478 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC41.83■■■■■ 4.29
DHX29Q7Z478 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
DHX29Q7Z478 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
DHX29Q7Z478 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC41.79■■■■■ 4.28
DHX29Q7Z478 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
DHX29Q7Z478 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
DHX29Q7Z478 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
DHX29Q7Z478 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC41.76■■■■■ 4.28
DHX29Q7Z478 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.76■■■■■ 4.28
DHX29Q7Z478 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
DHX29Q7Z478 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC41.74■■■■■ 4.27
DHX29Q7Z478 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC41.73■■■■■ 4.27
DHX29Q7Z478 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
DHX29Q7Z478 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
DHX29Q7Z478 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC41.69■■■■■ 4.26
DHX29Q7Z478 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
DHX29Q7Z478 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
DHX29Q7Z478 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC41.67■■■■■ 4.26
DHX29Q7Z478 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
DHX29Q7Z478 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
DHX29Q7Z478 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
DHX29Q7Z478 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC41.65■■■■■ 4.26
DHX29Q7Z478 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.65■■■■■ 4.26
DHX29Q7Z478 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
DHX29Q7Z478 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
DHX29Q7Z478 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
DHX29Q7Z478 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC41.63■■■■■ 4.26
DHX29Q7Z478 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.63■■■■■ 4.25
DHX29Q7Z478 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
DHX29Q7Z478 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC41.61■■■■■ 4.25
DHX29Q7Z478 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
DHX29Q7Z478 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC41.56■■■■■ 4.24
DHX29Q7Z478 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
DHX29Q7Z478 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
DHX29Q7Z478 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
DHX29Q7Z478 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC41.53■■■■■ 4.24
DHX29Q7Z478 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC41.51■■■■■ 4.24
DHX29Q7Z478 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
DHX29Q7Z478 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
DHX29Q7Z478 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC41.5■■■■■ 4.23
DHX29Q7Z478 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
DHX29Q7Z478 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.48■■■■■ 4.23
DHX29Q7Z478 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
DHX29Q7Z478 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC41.46■■■■■ 4.23
DHX29Q7Z478 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
DHX29Q7Z478 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
DHX29Q7Z478 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
DHX29Q7Z478 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
DHX29Q7Z478 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC41.37■■■■■ 4.21
DHX29Q7Z478 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.36■■■■■ 4.21
DHX29Q7Z478 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
DHX29Q7Z478 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
DHX29Q7Z478 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC41.32■■■■■ 4.21
DHX29Q7Z478 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
DHX29Q7Z478 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
DHX29Q7Z478 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC41.29■■■■■ 4.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms