Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3E5

ARMC9, LisH domain-containing protein ARMC9, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARMC9Q7Z3E5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
ARMC9Q7Z3E5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ARMC9Q7Z3E5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ARMC9Q7Z3E5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
ARMC9Q7Z3E5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ARMC9Q7Z3E5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
ARMC9Q7Z3E5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ARMC9Q7Z3E5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ARMC9Q7Z3E5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ARMC9Q7Z3E5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ARMC9Q7Z3E5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ARMC9Q7Z3E5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ARMC9Q7Z3E5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ARMC9Q7Z3E5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ARMC9Q7Z3E5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ARMC9Q7Z3E5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ARMC9Q7Z3E5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ARMC9Q7Z3E5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
ARMC9Q7Z3E5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ARMC9Q7Z3E5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ARMC9Q7Z3E5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ARMC9Q7Z3E5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
ARMC9Q7Z3E5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
ARMC9Q7Z3E5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
ARMC9Q7Z3E5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ARMC9Q7Z3E5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ARMC9Q7Z3E5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ARMC9Q7Z3E5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ARMC9Q7Z3E5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ARMC9Q7Z3E5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ARMC9Q7Z3E5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ARMC9Q7Z3E5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ARMC9Q7Z3E5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ARMC9Q7Z3E5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ARMC9Q7Z3E5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ARMC9Q7Z3E5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ARMC9Q7Z3E5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ARMC9Q7Z3E5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
ARMC9Q7Z3E5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ARMC9Q7Z3E5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ARMC9Q7Z3E5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ARMC9Q7Z3E5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ARMC9Q7Z3E5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ARMC9Q7Z3E5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
ARMC9Q7Z3E5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ARMC9Q7Z3E5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ARMC9Q7Z3E5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ARMC9Q7Z3E5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ARMC9Q7Z3E5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
ARMC9Q7Z3E5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
ARMC9Q7Z3E5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ARMC9Q7Z3E5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ARMC9Q7Z3E5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ARMC9Q7Z3E5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
ARMC9Q7Z3E5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
ARMC9Q7Z3E5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
ARMC9Q7Z3E5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
ARMC9Q7Z3E5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ARMC9Q7Z3E5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ARMC9Q7Z3E5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ARMC9Q7Z3E5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ARMC9Q7Z3E5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
ARMC9Q7Z3E5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
ARMC9Q7Z3E5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
ARMC9Q7Z3E5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
ARMC9Q7Z3E5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
ARMC9Q7Z3E5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
ARMC9Q7Z3E5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ARMC9Q7Z3E5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
ARMC9Q7Z3E5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ARMC9Q7Z3E5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ARMC9Q7Z3E5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
ARMC9Q7Z3E5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
ARMC9Q7Z3E5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
ARMC9Q7Z3E5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ARMC9Q7Z3E5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ARMC9Q7Z3E5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ARMC9Q7Z3E5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ARMC9Q7Z3E5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ARMC9Q7Z3E5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ARMC9Q7Z3E5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ARMC9Q7Z3E5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ARMC9Q7Z3E5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ARMC9Q7Z3E5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
ARMC9Q7Z3E5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ARMC9Q7Z3E5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ARMC9Q7Z3E5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ARMC9Q7Z3E5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ARMC9Q7Z3E5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ARMC9Q7Z3E5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ARMC9Q7Z3E5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ARMC9Q7Z3E5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ARMC9Q7Z3E5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ARMC9Q7Z3E5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ARMC9Q7Z3E5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
ARMC9Q7Z3E5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ARMC9Q7Z3E5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ARMC9Q7Z3E5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ARMC9Q7Z3E5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
ARMC9Q7Z3E5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms