Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2Z1

TICRR, Treslin, humanhuman

Predictions only

Length 1,910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TICRRQ7Z2Z1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TICRRQ7Z2Z1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TICRRQ7Z2Z1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TICRRQ7Z2Z1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TICRRQ7Z2Z1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TICRRQ7Z2Z1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TICRRQ7Z2Z1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TICRRQ7Z2Z1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TICRRQ7Z2Z1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TICRRQ7Z2Z1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TICRRQ7Z2Z1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TICRRQ7Z2Z1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TICRRQ7Z2Z1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TICRRQ7Z2Z1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TICRRQ7Z2Z1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TICRRQ7Z2Z1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
TICRRQ7Z2Z1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TICRRQ7Z2Z1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TICRRQ7Z2Z1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TICRRQ7Z2Z1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TICRRQ7Z2Z1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TICRRQ7Z2Z1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TICRRQ7Z2Z1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TICRRQ7Z2Z1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TICRRQ7Z2Z1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TICRRQ7Z2Z1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TICRRQ7Z2Z1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TICRRQ7Z2Z1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TICRRQ7Z2Z1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TICRRQ7Z2Z1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
TICRRQ7Z2Z1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TICRRQ7Z2Z1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TICRRQ7Z2Z1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TICRRQ7Z2Z1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TICRRQ7Z2Z1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TICRRQ7Z2Z1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TICRRQ7Z2Z1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TICRRQ7Z2Z1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TICRRQ7Z2Z1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TICRRQ7Z2Z1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TICRRQ7Z2Z1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TICRRQ7Z2Z1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TICRRQ7Z2Z1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TICRRQ7Z2Z1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TICRRQ7Z2Z1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TICRRQ7Z2Z1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TICRRQ7Z2Z1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TICRRQ7Z2Z1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TICRRQ7Z2Z1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TICRRQ7Z2Z1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TICRRQ7Z2Z1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TICRRQ7Z2Z1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TICRRQ7Z2Z1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TICRRQ7Z2Z1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TICRRQ7Z2Z1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TICRRQ7Z2Z1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TICRRQ7Z2Z1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TICRRQ7Z2Z1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TICRRQ7Z2Z1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
TICRRQ7Z2Z1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TICRRQ7Z2Z1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TICRRQ7Z2Z1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TICRRQ7Z2Z1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TICRRQ7Z2Z1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TICRRQ7Z2Z1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TICRRQ7Z2Z1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TICRRQ7Z2Z1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TICRRQ7Z2Z1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
TICRRQ7Z2Z1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TICRRQ7Z2Z1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TICRRQ7Z2Z1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TICRRQ7Z2Z1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TICRRQ7Z2Z1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TICRRQ7Z2Z1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TICRRQ7Z2Z1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TICRRQ7Z2Z1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TICRRQ7Z2Z1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TICRRQ7Z2Z1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TICRRQ7Z2Z1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TICRRQ7Z2Z1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TICRRQ7Z2Z1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TICRRQ7Z2Z1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TICRRQ7Z2Z1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TICRRQ7Z2Z1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TICRRQ7Z2Z1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TICRRQ7Z2Z1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TICRRQ7Z2Z1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TICRRQ7Z2Z1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TICRRQ7Z2Z1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TICRRQ7Z2Z1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TICRRQ7Z2Z1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TICRRQ7Z2Z1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TICRRQ7Z2Z1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TICRRQ7Z2Z1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TICRRQ7Z2Z1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TICRRQ7Z2Z1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TICRRQ7Z2Z1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TICRRQ7Z2Z1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TICRRQ7Z2Z1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TICRRQ7Z2Z1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms