Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC80Q76M96 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC80Q76M96 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC80Q76M96 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC80Q76M96 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC80Q76M96 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC80Q76M96 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC80Q76M96 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC80Q76M96 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC80Q76M96 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC80Q76M96 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC80Q76M96 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC80Q76M96 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC80Q76M96 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC80Q76M96 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC80Q76M96 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC80Q76M96 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC80Q76M96 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC80Q76M96 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC80Q76M96 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC80Q76M96 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC80Q76M96 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC80Q76M96 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC80Q76M96 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC80Q76M96 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC80Q76M96 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC80Q76M96 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC80Q76M96 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC80Q76M96 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC80Q76M96 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC80Q76M96 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC80Q76M96 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC80Q76M96 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC80Q76M96 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC80Q76M96 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC80Q76M96 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC80Q76M96 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC80Q76M96 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC80Q76M96 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CCDC80Q76M96 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC80Q76M96 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC80Q76M96 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC80Q76M96 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC80Q76M96 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC80Q76M96 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC80Q76M96 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC80Q76M96 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC80Q76M96 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC80Q76M96 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC80Q76M96 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC80Q76M96 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC80Q76M96 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC80Q76M96 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC80Q76M96 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC80Q76M96 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC80Q76M96 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC80Q76M96 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC80Q76M96 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC80Q76M96 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC80Q76M96 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC80Q76M96 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC80Q76M96 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC80Q76M96 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC80Q76M96 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC80Q76M96 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC80Q76M96 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC80Q76M96 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC80Q76M96 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC80Q76M96 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC80Q76M96 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC80Q76M96 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC80Q76M96 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC80Q76M96 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC80Q76M96 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC80Q76M96 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC80Q76M96 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC80Q76M96 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC80Q76M96 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC80Q76M96 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC80Q76M96 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC80Q76M96 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC80Q76M96 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC80Q76M96 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC80Q76M96 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC80Q76M96 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC80Q76M96 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC80Q76M96 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC80Q76M96 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC80Q76M96 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC80Q76M96 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC80Q76M96 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC80Q76M96 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC80Q76M96 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC80Q76M96 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC80Q76M96 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC80Q76M96 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC80Q76M96 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC80Q76M96 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC80Q76M96 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC80Q76M96 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms