Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PAXIP1Q6ZW49 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PAXIP1Q6ZW49 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PAXIP1Q6ZW49 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PAXIP1Q6ZW49 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PAXIP1Q6ZW49 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PAXIP1Q6ZW49 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PAXIP1Q6ZW49 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PAXIP1Q6ZW49 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
PAXIP1Q6ZW49 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PAXIP1Q6ZW49 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PAXIP1Q6ZW49 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PAXIP1Q6ZW49 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PAXIP1Q6ZW49 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PAXIP1Q6ZW49 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PAXIP1Q6ZW49 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
PAXIP1Q6ZW49 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PAXIP1Q6ZW49 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PAXIP1Q6ZW49 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PAXIP1Q6ZW49 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
PAXIP1Q6ZW49 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PAXIP1Q6ZW49 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PAXIP1Q6ZW49 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PAXIP1Q6ZW49 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PAXIP1Q6ZW49 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
PAXIP1Q6ZW49 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PAXIP1Q6ZW49 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PAXIP1Q6ZW49 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PAXIP1Q6ZW49 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PAXIP1Q6ZW49 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PAXIP1Q6ZW49 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PAXIP1Q6ZW49 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PAXIP1Q6ZW49 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PAXIP1Q6ZW49 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PAXIP1Q6ZW49 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
PAXIP1Q6ZW49 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PAXIP1Q6ZW49 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PAXIP1Q6ZW49 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PAXIP1Q6ZW49 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PAXIP1Q6ZW49 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PAXIP1Q6ZW49 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PAXIP1Q6ZW49 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
PAXIP1Q6ZW49 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PAXIP1Q6ZW49 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PAXIP1Q6ZW49 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PAXIP1Q6ZW49 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PAXIP1Q6ZW49 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
PAXIP1Q6ZW49 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
PAXIP1Q6ZW49 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PAXIP1Q6ZW49 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PAXIP1Q6ZW49 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PAXIP1Q6ZW49 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PAXIP1Q6ZW49 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PAXIP1Q6ZW49 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PAXIP1Q6ZW49 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PAXIP1Q6ZW49 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PAXIP1Q6ZW49 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PAXIP1Q6ZW49 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PAXIP1Q6ZW49 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PAXIP1Q6ZW49 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PAXIP1Q6ZW49 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PAXIP1Q6ZW49 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PAXIP1Q6ZW49 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PAXIP1Q6ZW49 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PAXIP1Q6ZW49 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PAXIP1Q6ZW49 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PAXIP1Q6ZW49 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PAXIP1Q6ZW49 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PAXIP1Q6ZW49 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PAXIP1Q6ZW49 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PAXIP1Q6ZW49 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PAXIP1Q6ZW49 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PAXIP1Q6ZW49 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PAXIP1Q6ZW49 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PAXIP1Q6ZW49 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PAXIP1Q6ZW49 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PAXIP1Q6ZW49 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PAXIP1Q6ZW49 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PAXIP1Q6ZW49 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PAXIP1Q6ZW49 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
PAXIP1Q6ZW49 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PAXIP1Q6ZW49 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PAXIP1Q6ZW49 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PAXIP1Q6ZW49 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PAXIP1Q6ZW49 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PAXIP1Q6ZW49 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PAXIP1Q6ZW49 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PAXIP1Q6ZW49 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PAXIP1Q6ZW49 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PAXIP1Q6ZW49 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PAXIP1Q6ZW49 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PAXIP1Q6ZW49 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PAXIP1Q6ZW49 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
PAXIP1Q6ZW49 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PAXIP1Q6ZW49 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
PAXIP1Q6ZW49 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PAXIP1Q6ZW49 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
PAXIP1Q6ZW49 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PAXIP1Q6ZW49 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PAXIP1Q6ZW49 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms