Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf139Q6ZV77 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf139Q6ZV77 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9orf139Q6ZV77 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9orf139Q6ZV77 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C9orf139Q6ZV77 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C9orf139Q6ZV77 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf139Q6ZV77 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf139Q6ZV77 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf139Q6ZV77 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf139Q6ZV77 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf139Q6ZV77 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf139Q6ZV77 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf139Q6ZV77 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf139Q6ZV77 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf139Q6ZV77 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf139Q6ZV77 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf139Q6ZV77 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf139Q6ZV77 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf139Q6ZV77 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf139Q6ZV77 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C9orf139Q6ZV77 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C9orf139Q6ZV77 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf139Q6ZV77 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf139Q6ZV77 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf139Q6ZV77 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf139Q6ZV77 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf139Q6ZV77 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf139Q6ZV77 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf139Q6ZV77 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf139Q6ZV77 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf139Q6ZV77 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf139Q6ZV77 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf139Q6ZV77 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf139Q6ZV77 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf139Q6ZV77 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf139Q6ZV77 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf139Q6ZV77 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf139Q6ZV77 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf139Q6ZV77 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf139Q6ZV77 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf139Q6ZV77 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf139Q6ZV77 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf139Q6ZV77 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf139Q6ZV77 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf139Q6ZV77 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf139Q6ZV77 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf139Q6ZV77 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf139Q6ZV77 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf139Q6ZV77 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C9orf139Q6ZV77 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf139Q6ZV77 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf139Q6ZV77 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf139Q6ZV77 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf139Q6ZV77 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf139Q6ZV77 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf139Q6ZV77 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf139Q6ZV77 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf139Q6ZV77 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf139Q6ZV77 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf139Q6ZV77 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf139Q6ZV77 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf139Q6ZV77 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf139Q6ZV77 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf139Q6ZV77 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf139Q6ZV77 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf139Q6ZV77 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf139Q6ZV77 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf139Q6ZV77 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf139Q6ZV77 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf139Q6ZV77 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf139Q6ZV77 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf139Q6ZV77 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf139Q6ZV77 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf139Q6ZV77 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf139Q6ZV77 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf139Q6ZV77 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf139Q6ZV77 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf139Q6ZV77 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf139Q6ZV77 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf139Q6ZV77 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf139Q6ZV77 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf139Q6ZV77 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
C9orf139Q6ZV77 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf139Q6ZV77 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf139Q6ZV77 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf139Q6ZV77 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf139Q6ZV77 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf139Q6ZV77 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf139Q6ZV77 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf139Q6ZV77 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf139Q6ZV77 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf139Q6ZV77 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf139Q6ZV77 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf139Q6ZV77 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf139Q6ZV77 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf139Q6ZV77 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf139Q6ZV77 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf139Q6ZV77 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf139Q6ZV77 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms