Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BEND4Q6ZU67 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BEND4Q6ZU67 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BEND4Q6ZU67 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
BEND4Q6ZU67 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BEND4Q6ZU67 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BEND4Q6ZU67 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BEND4Q6ZU67 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BEND4Q6ZU67 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BEND4Q6ZU67 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BEND4Q6ZU67 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BEND4Q6ZU67 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BEND4Q6ZU67 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BEND4Q6ZU67 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BEND4Q6ZU67 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BEND4Q6ZU67 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BEND4Q6ZU67 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BEND4Q6ZU67 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BEND4Q6ZU67 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BEND4Q6ZU67 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BEND4Q6ZU67 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BEND4Q6ZU67 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BEND4Q6ZU67 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
BEND4Q6ZU67 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BEND4Q6ZU67 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BEND4Q6ZU67 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BEND4Q6ZU67 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BEND4Q6ZU67 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BEND4Q6ZU67 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BEND4Q6ZU67 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BEND4Q6ZU67 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BEND4Q6ZU67 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BEND4Q6ZU67 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BEND4Q6ZU67 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BEND4Q6ZU67 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BEND4Q6ZU67 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
BEND4Q6ZU67 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BEND4Q6ZU67 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BEND4Q6ZU67 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BEND4Q6ZU67 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BEND4Q6ZU67 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BEND4Q6ZU67 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BEND4Q6ZU67 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BEND4Q6ZU67 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BEND4Q6ZU67 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BEND4Q6ZU67 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BEND4Q6ZU67 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BEND4Q6ZU67 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BEND4Q6ZU67 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BEND4Q6ZU67 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BEND4Q6ZU67 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BEND4Q6ZU67 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BEND4Q6ZU67 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BEND4Q6ZU67 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BEND4Q6ZU67 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BEND4Q6ZU67 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BEND4Q6ZU67 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BEND4Q6ZU67 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BEND4Q6ZU67 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BEND4Q6ZU67 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BEND4Q6ZU67 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BEND4Q6ZU67 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BEND4Q6ZU67 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BEND4Q6ZU67 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BEND4Q6ZU67 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BEND4Q6ZU67 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BEND4Q6ZU67 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BEND4Q6ZU67 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BEND4Q6ZU67 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BEND4Q6ZU67 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BEND4Q6ZU67 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BEND4Q6ZU67 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BEND4Q6ZU67 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BEND4Q6ZU67 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BEND4Q6ZU67 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BEND4Q6ZU67 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BEND4Q6ZU67 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BEND4Q6ZU67 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BEND4Q6ZU67 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BEND4Q6ZU67 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BEND4Q6ZU67 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BEND4Q6ZU67 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BEND4Q6ZU67 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BEND4Q6ZU67 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BEND4Q6ZU67 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BEND4Q6ZU67 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BEND4Q6ZU67 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BEND4Q6ZU67 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BEND4Q6ZU67 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BEND4Q6ZU67 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BEND4Q6ZU67 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BEND4Q6ZU67 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BEND4Q6ZU67 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BEND4Q6ZU67 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BEND4Q6ZU67 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BEND4Q6ZU67 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BEND4Q6ZU67 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BEND4Q6ZU67 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BEND4Q6ZU67 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BEND4Q6ZU67 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms