Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TREML4Q6UXN2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TREML4Q6UXN2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TREML4Q6UXN2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TREML4Q6UXN2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TREML4Q6UXN2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TREML4Q6UXN2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TREML4Q6UXN2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TREML4Q6UXN2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TREML4Q6UXN2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TREML4Q6UXN2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TREML4Q6UXN2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TREML4Q6UXN2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TREML4Q6UXN2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TREML4Q6UXN2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TREML4Q6UXN2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TREML4Q6UXN2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TREML4Q6UXN2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TREML4Q6UXN2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TREML4Q6UXN2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TREML4Q6UXN2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TREML4Q6UXN2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TREML4Q6UXN2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TREML4Q6UXN2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TREML4Q6UXN2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TREML4Q6UXN2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TREML4Q6UXN2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TREML4Q6UXN2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TREML4Q6UXN2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TREML4Q6UXN2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TREML4Q6UXN2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TREML4Q6UXN2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TREML4Q6UXN2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TREML4Q6UXN2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TREML4Q6UXN2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TREML4Q6UXN2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TREML4Q6UXN2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TREML4Q6UXN2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TREML4Q6UXN2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TREML4Q6UXN2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TREML4Q6UXN2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TREML4Q6UXN2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TREML4Q6UXN2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TREML4Q6UXN2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TREML4Q6UXN2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TREML4Q6UXN2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TREML4Q6UXN2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TREML4Q6UXN2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TREML4Q6UXN2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TREML4Q6UXN2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREML4Q6UXN2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREML4Q6UXN2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREML4Q6UXN2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREML4Q6UXN2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREML4Q6UXN2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREML4Q6UXN2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TREML4Q6UXN2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TREML4Q6UXN2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TREML4Q6UXN2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TREML4Q6UXN2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TREML4Q6UXN2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TREML4Q6UXN2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TREML4Q6UXN2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TREML4Q6UXN2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TREML4Q6UXN2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TREML4Q6UXN2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TREML4Q6UXN2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TREML4Q6UXN2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TREML4Q6UXN2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TREML4Q6UXN2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TREML4Q6UXN2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TREML4Q6UXN2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TREML4Q6UXN2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TREML4Q6UXN2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TREML4Q6UXN2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TREML4Q6UXN2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TREML4Q6UXN2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TREML4Q6UXN2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TREML4Q6UXN2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TREML4Q6UXN2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TREML4Q6UXN2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TREML4Q6UXN2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TREML4Q6UXN2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TREML4Q6UXN2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TREML4Q6UXN2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TREML4Q6UXN2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TREML4Q6UXN2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TREML4Q6UXN2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TREML4Q6UXN2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TREML4Q6UXN2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TREML4Q6UXN2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TREML4Q6UXN2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TREML4Q6UXN2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TREML4Q6UXN2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TREML4Q6UXN2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TREML4Q6UXN2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TREML4Q6UXN2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TREML4Q6UXN2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TREML4Q6UXN2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TREML4Q6UXN2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms