Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABRAXAS1Q6UWZ7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABRAXAS1Q6UWZ7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABRAXAS1Q6UWZ7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ABRAXAS1Q6UWZ7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABRAXAS1Q6UWZ7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABRAXAS1Q6UWZ7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABRAXAS1Q6UWZ7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABRAXAS1Q6UWZ7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABRAXAS1Q6UWZ7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABRAXAS1Q6UWZ7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABRAXAS1Q6UWZ7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABRAXAS1Q6UWZ7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ABRAXAS1Q6UWZ7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABRAXAS1Q6UWZ7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABRAXAS1Q6UWZ7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABRAXAS1Q6UWZ7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABRAXAS1Q6UWZ7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABRAXAS1Q6UWZ7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms