Protein–RNA interactions for Protein: Q6P499

NIPAL3, NIPA-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL3Q6P499 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NIPAL3Q6P499 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NIPAL3Q6P499 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NIPAL3Q6P499 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NIPAL3Q6P499 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NIPAL3Q6P499 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NIPAL3Q6P499 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NIPAL3Q6P499 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NIPAL3Q6P499 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NIPAL3Q6P499 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NIPAL3Q6P499 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NIPAL3Q6P499 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NIPAL3Q6P499 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NIPAL3Q6P499 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NIPAL3Q6P499 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NIPAL3Q6P499 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NIPAL3Q6P499 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NIPAL3Q6P499 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NIPAL3Q6P499 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NIPAL3Q6P499 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NIPAL3Q6P499 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NIPAL3Q6P499 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NIPAL3Q6P499 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NIPAL3Q6P499 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NIPAL3Q6P499 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NIPAL3Q6P499 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NIPAL3Q6P499 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NIPAL3Q6P499 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NIPAL3Q6P499 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NIPAL3Q6P499 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NIPAL3Q6P499 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NIPAL3Q6P499 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NIPAL3Q6P499 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NIPAL3Q6P499 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NIPAL3Q6P499 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NIPAL3Q6P499 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NIPAL3Q6P499 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NIPAL3Q6P499 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NIPAL3Q6P499 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NIPAL3Q6P499 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NIPAL3Q6P499 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NIPAL3Q6P499 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NIPAL3Q6P499 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NIPAL3Q6P499 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NIPAL3Q6P499 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NIPAL3Q6P499 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NIPAL3Q6P499 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NIPAL3Q6P499 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NIPAL3Q6P499 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NIPAL3Q6P499 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NIPAL3Q6P499 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NIPAL3Q6P499 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NIPAL3Q6P499 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NIPAL3Q6P499 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NIPAL3Q6P499 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NIPAL3Q6P499 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NIPAL3Q6P499 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NIPAL3Q6P499 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NIPAL3Q6P499 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NIPAL3Q6P499 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NIPAL3Q6P499 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NIPAL3Q6P499 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NIPAL3Q6P499 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NIPAL3Q6P499 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NIPAL3Q6P499 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NIPAL3Q6P499 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NIPAL3Q6P499 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NIPAL3Q6P499 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NIPAL3Q6P499 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NIPAL3Q6P499 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NIPAL3Q6P499 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NIPAL3Q6P499 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NIPAL3Q6P499 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NIPAL3Q6P499 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NIPAL3Q6P499 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NIPAL3Q6P499 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NIPAL3Q6P499 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NIPAL3Q6P499 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NIPAL3Q6P499 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NIPAL3Q6P499 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NIPAL3Q6P499 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NIPAL3Q6P499 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NIPAL3Q6P499 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NIPAL3Q6P499 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NIPAL3Q6P499 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NIPAL3Q6P499 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NIPAL3Q6P499 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NIPAL3Q6P499 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NIPAL3Q6P499 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NIPAL3Q6P499 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NIPAL3Q6P499 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NIPAL3Q6P499 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NIPAL3Q6P499 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NIPAL3Q6P499 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NIPAL3Q6P499 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NIPAL3Q6P499 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NIPAL3Q6P499 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NIPAL3Q6P499 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NIPAL3Q6P499 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NIPAL3Q6P499 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms