Protein–RNA interactions for Protein: Q6NY19

KANK3, KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KANK3Q6NY19 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
KANK3Q6NY19 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
KANK3Q6NY19 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
KANK3Q6NY19 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
KANK3Q6NY19 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
KANK3Q6NY19 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
KANK3Q6NY19 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
KANK3Q6NY19 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
KANK3Q6NY19 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
KANK3Q6NY19 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
KANK3Q6NY19 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
KANK3Q6NY19 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
KANK3Q6NY19 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
KANK3Q6NY19 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
KANK3Q6NY19 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
KANK3Q6NY19 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
KANK3Q6NY19 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
KANK3Q6NY19 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
KANK3Q6NY19 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
KANK3Q6NY19 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
KANK3Q6NY19 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
KANK3Q6NY19 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
KANK3Q6NY19 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
KANK3Q6NY19 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
KANK3Q6NY19 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
KANK3Q6NY19 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
KANK3Q6NY19 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
KANK3Q6NY19 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
KANK3Q6NY19 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
KANK3Q6NY19 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
KANK3Q6NY19 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
KANK3Q6NY19 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
KANK3Q6NY19 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
KANK3Q6NY19 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
KANK3Q6NY19 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
KANK3Q6NY19 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
KANK3Q6NY19 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
KANK3Q6NY19 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
KANK3Q6NY19 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
KANK3Q6NY19 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
KANK3Q6NY19 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
KANK3Q6NY19 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
KANK3Q6NY19 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
KANK3Q6NY19 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
KANK3Q6NY19 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
KANK3Q6NY19 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
KANK3Q6NY19 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
KANK3Q6NY19 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
KANK3Q6NY19 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
KANK3Q6NY19 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
KANK3Q6NY19 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
KANK3Q6NY19 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
KANK3Q6NY19 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
KANK3Q6NY19 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
KANK3Q6NY19 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
KANK3Q6NY19 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
KANK3Q6NY19 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
KANK3Q6NY19 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
KANK3Q6NY19 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
KANK3Q6NY19 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
KANK3Q6NY19 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
KANK3Q6NY19 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
KANK3Q6NY19 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
KANK3Q6NY19 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
KANK3Q6NY19 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
KANK3Q6NY19 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
KANK3Q6NY19 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
KANK3Q6NY19 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
KANK3Q6NY19 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
KANK3Q6NY19 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
KANK3Q6NY19 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
KANK3Q6NY19 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
KANK3Q6NY19 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
KANK3Q6NY19 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
KANK3Q6NY19 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
KANK3Q6NY19 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
KANK3Q6NY19 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
KANK3Q6NY19 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
KANK3Q6NY19 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
KANK3Q6NY19 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
KANK3Q6NY19 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
KANK3Q6NY19 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
KANK3Q6NY19 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
KANK3Q6NY19 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
KANK3Q6NY19 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
KANK3Q6NY19 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
KANK3Q6NY19 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
KANK3Q6NY19 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
KANK3Q6NY19 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
KANK3Q6NY19 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
KANK3Q6NY19 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
KANK3Q6NY19 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
KANK3Q6NY19 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
KANK3Q6NY19 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
KANK3Q6NY19 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
KANK3Q6NY19 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
KANK3Q6NY19 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
KANK3Q6NY19 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
KANK3Q6NY19 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
KANK3Q6NY19 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms