Protein–RNA interactions for Protein: Q6NY19

KANK3, KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KANK3Q6NY19 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
KANK3Q6NY19 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
KANK3Q6NY19 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
KANK3Q6NY19 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
KANK3Q6NY19 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
KANK3Q6NY19 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
KANK3Q6NY19 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
KANK3Q6NY19 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
KANK3Q6NY19 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
KANK3Q6NY19 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
KANK3Q6NY19 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
KANK3Q6NY19 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
KANK3Q6NY19 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
KANK3Q6NY19 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
KANK3Q6NY19 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
KANK3Q6NY19 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
KANK3Q6NY19 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
KANK3Q6NY19 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
KANK3Q6NY19 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
KANK3Q6NY19 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
KANK3Q6NY19 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
KANK3Q6NY19 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
KANK3Q6NY19 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
KANK3Q6NY19 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
KANK3Q6NY19 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
KANK3Q6NY19 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
KANK3Q6NY19 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
KANK3Q6NY19 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
KANK3Q6NY19 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
KANK3Q6NY19 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
KANK3Q6NY19 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
KANK3Q6NY19 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
KANK3Q6NY19 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
KANK3Q6NY19 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
KANK3Q6NY19 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
KANK3Q6NY19 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
KANK3Q6NY19 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
KANK3Q6NY19 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
KANK3Q6NY19 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
KANK3Q6NY19 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
KANK3Q6NY19 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
KANK3Q6NY19 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
KANK3Q6NY19 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
KANK3Q6NY19 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
KANK3Q6NY19 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
KANK3Q6NY19 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
KANK3Q6NY19 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
KANK3Q6NY19 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
KANK3Q6NY19 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
KANK3Q6NY19 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
KANK3Q6NY19 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
KANK3Q6NY19 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
KANK3Q6NY19 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
KANK3Q6NY19 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
KANK3Q6NY19 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
KANK3Q6NY19 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
KANK3Q6NY19 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
KANK3Q6NY19 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
KANK3Q6NY19 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
KANK3Q6NY19 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
KANK3Q6NY19 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
KANK3Q6NY19 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
KANK3Q6NY19 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
KANK3Q6NY19 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
KANK3Q6NY19 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
KANK3Q6NY19 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
KANK3Q6NY19 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
KANK3Q6NY19 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
KANK3Q6NY19 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
KANK3Q6NY19 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
KANK3Q6NY19 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
KANK3Q6NY19 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
KANK3Q6NY19 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
KANK3Q6NY19 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
KANK3Q6NY19 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
KANK3Q6NY19 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
KANK3Q6NY19 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
KANK3Q6NY19 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
KANK3Q6NY19 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
KANK3Q6NY19 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
KANK3Q6NY19 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
KANK3Q6NY19 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
KANK3Q6NY19 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
KANK3Q6NY19 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
KANK3Q6NY19 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
KANK3Q6NY19 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
KANK3Q6NY19 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
KANK3Q6NY19 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
KANK3Q6NY19 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
KANK3Q6NY19 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
KANK3Q6NY19 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
KANK3Q6NY19 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
KANK3Q6NY19 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
KANK3Q6NY19 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
KANK3Q6NY19 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
KANK3Q6NY19 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
KANK3Q6NY19 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
KANK3Q6NY19 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
KANK3Q6NY19 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
KANK3Q6NY19 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 6.7 ms