Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI1

CCDC144NL, Putative coiled-coil domain-containing protein 144 N-terminal-like, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144NLQ6NUI1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC144NLQ6NUI1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC144NLQ6NUI1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC144NLQ6NUI1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC144NLQ6NUI1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC144NLQ6NUI1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC144NLQ6NUI1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC144NLQ6NUI1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC144NLQ6NUI1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC144NLQ6NUI1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC144NLQ6NUI1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC144NLQ6NUI1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC144NLQ6NUI1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC144NLQ6NUI1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC144NLQ6NUI1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC144NLQ6NUI1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC144NLQ6NUI1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC144NLQ6NUI1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC144NLQ6NUI1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC144NLQ6NUI1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC144NLQ6NUI1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC144NLQ6NUI1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC144NLQ6NUI1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC144NLQ6NUI1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC144NLQ6NUI1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC144NLQ6NUI1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC144NLQ6NUI1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC144NLQ6NUI1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC144NLQ6NUI1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC144NLQ6NUI1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC144NLQ6NUI1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC144NLQ6NUI1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC144NLQ6NUI1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC144NLQ6NUI1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC144NLQ6NUI1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC144NLQ6NUI1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC144NLQ6NUI1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC144NLQ6NUI1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC144NLQ6NUI1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC144NLQ6NUI1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC144NLQ6NUI1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC144NLQ6NUI1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC144NLQ6NUI1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC144NLQ6NUI1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC144NLQ6NUI1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC144NLQ6NUI1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC144NLQ6NUI1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC144NLQ6NUI1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC144NLQ6NUI1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC144NLQ6NUI1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC144NLQ6NUI1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC144NLQ6NUI1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC144NLQ6NUI1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC144NLQ6NUI1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144NLQ6NUI1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144NLQ6NUI1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144NLQ6NUI1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144NLQ6NUI1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC144NLQ6NUI1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC144NLQ6NUI1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC144NLQ6NUI1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC144NLQ6NUI1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC144NLQ6NUI1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC144NLQ6NUI1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC144NLQ6NUI1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC144NLQ6NUI1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC144NLQ6NUI1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC144NLQ6NUI1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC144NLQ6NUI1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC144NLQ6NUI1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC144NLQ6NUI1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC144NLQ6NUI1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC144NLQ6NUI1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC144NLQ6NUI1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC144NLQ6NUI1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC144NLQ6NUI1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC144NLQ6NUI1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC144NLQ6NUI1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC144NLQ6NUI1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC144NLQ6NUI1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC144NLQ6NUI1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC144NLQ6NUI1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC144NLQ6NUI1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC144NLQ6NUI1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC144NLQ6NUI1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC144NLQ6NUI1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC144NLQ6NUI1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC144NLQ6NUI1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC144NLQ6NUI1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC144NLQ6NUI1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC144NLQ6NUI1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC144NLQ6NUI1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC144NLQ6NUI1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC144NLQ6NUI1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC144NLQ6NUI1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC144NLQ6NUI1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC144NLQ6NUI1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC144NLQ6NUI1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms