Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZP7

LIN54, Protein lin-54 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN54Q6MZP7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LIN54Q6MZP7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LIN54Q6MZP7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIN54Q6MZP7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIN54Q6MZP7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIN54Q6MZP7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIN54Q6MZP7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIN54Q6MZP7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LIN54Q6MZP7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LIN54Q6MZP7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIN54Q6MZP7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIN54Q6MZP7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIN54Q6MZP7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIN54Q6MZP7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIN54Q6MZP7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
LIN54Q6MZP7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIN54Q6MZP7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIN54Q6MZP7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIN54Q6MZP7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIN54Q6MZP7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIN54Q6MZP7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIN54Q6MZP7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIN54Q6MZP7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIN54Q6MZP7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIN54Q6MZP7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIN54Q6MZP7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LIN54Q6MZP7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LIN54Q6MZP7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIN54Q6MZP7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIN54Q6MZP7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIN54Q6MZP7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIN54Q6MZP7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIN54Q6MZP7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LIN54Q6MZP7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LIN54Q6MZP7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LIN54Q6MZP7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIN54Q6MZP7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIN54Q6MZP7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIN54Q6MZP7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIN54Q6MZP7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIN54Q6MZP7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIN54Q6MZP7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIN54Q6MZP7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LIN54Q6MZP7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIN54Q6MZP7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIN54Q6MZP7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIN54Q6MZP7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIN54Q6MZP7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIN54Q6MZP7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIN54Q6MZP7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIN54Q6MZP7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIN54Q6MZP7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIN54Q6MZP7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LIN54Q6MZP7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIN54Q6MZP7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIN54Q6MZP7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIN54Q6MZP7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIN54Q6MZP7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIN54Q6MZP7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIN54Q6MZP7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LIN54Q6MZP7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIN54Q6MZP7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIN54Q6MZP7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIN54Q6MZP7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIN54Q6MZP7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIN54Q6MZP7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIN54Q6MZP7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIN54Q6MZP7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LIN54Q6MZP7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LIN54Q6MZP7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LIN54Q6MZP7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LIN54Q6MZP7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIN54Q6MZP7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIN54Q6MZP7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIN54Q6MZP7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIN54Q6MZP7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIN54Q6MZP7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIN54Q6MZP7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIN54Q6MZP7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIN54Q6MZP7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIN54Q6MZP7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIN54Q6MZP7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIN54Q6MZP7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIN54Q6MZP7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LIN54Q6MZP7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIN54Q6MZP7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIN54Q6MZP7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIN54Q6MZP7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIN54Q6MZP7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIN54Q6MZP7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIN54Q6MZP7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIN54Q6MZP7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIN54Q6MZP7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIN54Q6MZP7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIN54Q6MZP7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LIN54Q6MZP7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LIN54Q6MZP7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LIN54Q6MZP7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LIN54Q6MZP7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LIN54Q6MZP7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1030.2 ms