Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZP7

LIN54, Protein lin-54 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN54Q6MZP7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LIN54Q6MZP7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LIN54Q6MZP7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LIN54Q6MZP7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LIN54Q6MZP7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LIN54Q6MZP7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LIN54Q6MZP7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LIN54Q6MZP7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LIN54Q6MZP7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LIN54Q6MZP7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LIN54Q6MZP7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LIN54Q6MZP7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LIN54Q6MZP7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LIN54Q6MZP7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LIN54Q6MZP7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
LIN54Q6MZP7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LIN54Q6MZP7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LIN54Q6MZP7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LIN54Q6MZP7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LIN54Q6MZP7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LIN54Q6MZP7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LIN54Q6MZP7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LIN54Q6MZP7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LIN54Q6MZP7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LIN54Q6MZP7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LIN54Q6MZP7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LIN54Q6MZP7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LIN54Q6MZP7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LIN54Q6MZP7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LIN54Q6MZP7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LIN54Q6MZP7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LIN54Q6MZP7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LIN54Q6MZP7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LIN54Q6MZP7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LIN54Q6MZP7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LIN54Q6MZP7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LIN54Q6MZP7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LIN54Q6MZP7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LIN54Q6MZP7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LIN54Q6MZP7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LIN54Q6MZP7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LIN54Q6MZP7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LIN54Q6MZP7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LIN54Q6MZP7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LIN54Q6MZP7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LIN54Q6MZP7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LIN54Q6MZP7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LIN54Q6MZP7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LIN54Q6MZP7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LIN54Q6MZP7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LIN54Q6MZP7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LIN54Q6MZP7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LIN54Q6MZP7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LIN54Q6MZP7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LIN54Q6MZP7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LIN54Q6MZP7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LIN54Q6MZP7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LIN54Q6MZP7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIN54Q6MZP7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIN54Q6MZP7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LIN54Q6MZP7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LIN54Q6MZP7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LIN54Q6MZP7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LIN54Q6MZP7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LIN54Q6MZP7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LIN54Q6MZP7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LIN54Q6MZP7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LIN54Q6MZP7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LIN54Q6MZP7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LIN54Q6MZP7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIN54Q6MZP7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LIN54Q6MZP7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LIN54Q6MZP7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LIN54Q6MZP7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LIN54Q6MZP7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LIN54Q6MZP7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LIN54Q6MZP7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LIN54Q6MZP7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIN54Q6MZP7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIN54Q6MZP7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LIN54Q6MZP7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LIN54Q6MZP7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIN54Q6MZP7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIN54Q6MZP7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIN54Q6MZP7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIN54Q6MZP7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LIN54Q6MZP7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LIN54Q6MZP7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIN54Q6MZP7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LIN54Q6MZP7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LIN54Q6MZP7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LIN54Q6MZP7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LIN54Q6MZP7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LIN54Q6MZP7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LIN54Q6MZP7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LIN54Q6MZP7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LIN54Q6MZP7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIN54Q6MZP7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LIN54Q6MZP7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LIN54Q6MZP7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 290.2 ms